B細胞陰性重症複合免疫不全症NGS遺伝子パネル検査｜ミネルバクリニック

ADA, AK2, CORO1A, DCLRE1C, LIG4, NBN, NHEJ1, PGM3, PRKDC, RAC2, RAG1, RAG2, TTC7A ( 13遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ADA遺伝子：
アデノシンデアミナーゼをコードする遺伝子。常染色体劣性遺伝形式で、この酵素の欠損により、デオキシアデノシンとその代謝産物が蓄積し、T細胞、B細胞、NK細胞の前駆細胞にアポトーシスをもたらします。表現型はT- B- NK-で、SCIDの中で2番目に頻度が高い病型です。骨異常を伴うことがあります。酵素補充療法や遺伝子治療の対象となります。

・AK2遺伝子：
アデニル酸キナーゼ2をコードする遺伝子。ミトコンドリアのエネルギー代謝に関与し、網状赤血球減少性貧血を伴うSCIDの原因となります。

・CORO1A遺伝子：
コロニン1Aをコードする遺伝子。T細胞の生存とエグレス（胸腺からの出現）に重要な役割を果たします。常染色体劣性遺伝形式で、T細胞の欠損を引き起こします。

・DCLRE1C遺伝子（Artemis）：
DNA修復酵素Artemisをコードする遺伝子。V(D)J組換え過程のDNA末端処理に必要で、常染色体劣性遺伝形式をとります。主にアパッチ族やナバホ族の子孫に発生する稀な型で、放射線感受性が高いことが特徴です。

・LIG4遺伝子：
DNAリガーゼIVをコードする遺伝子。DNA二本鎖切断の修復（非相同末端結合）とV(D)J組換えに関与します。常染色体劣性遺伝形式で、小頭症、顔貌異常、発達遅滞などの身体的特徴を伴うことがあります。放射線感受性が高いです。

・NBN遺伝子：
ニブリン（NBS1）をコードする遺伝子。DNA修復と細胞周期制御に関与し、ナイミーヘン症候群の原因遺伝子です。小頭症、特徴的顔貌、成長障害を伴い、悪性腫瘍のリスクが高いことが特徴です。

・NHEJ1遺伝子（Cernunnos/XLF）：
非相同末端結合因子1（Cernunnos）をコードする遺伝子。DNA二本鎖切断の修復に関与し、常染色体劣性遺伝形式をとります。小頭症を伴うことがあり、放射線感受性が高いです。

・PGM3遺伝子：
ホスホグルコムターゼ3をコードする遺伝子。糖代謝（特にN-グリコシル化）に関与します。常染色体劣性遺伝形式で、免疫不全に加えて神経学的異常、アトピー、自己免疫疾患を伴うことがあります。

・PRKDC遺伝子：
DNA依存性プロテインキナーゼ触媒サブユニット（DNA-PKcs）をコードする遺伝子。DNA修復とV(D)J組換えに必須の役割を果たします。常染色体劣性遺伝形式で、放射線感受性が高いです。

・RAC2遺伝子：
低分子量GTPアーゼRac2をコードする遺伝子。好中球の機能（遊走、貪食、酸化的殺菌）に重要な役割を果たします。好中球機能障害を伴う免疫不全症の原因となります。

・RAG1遺伝子：
組換え活性化遺伝子1をコードする遺伝子。V(D)J組換えに必須で、T細胞受容体とB細胞受容体の遺伝子再構成を制御します。常染色体劣性遺伝形式で、完全欠損型はT- B- NK+ SCIDを、部分的欠損型はオーメン症候群やleaky SCIDを引き起こします。

・RAG2遺伝子：
組換え活性化遺伝子2をコードする遺伝子。RAG1と同様にV(D)J組換えに必須です。常染色体劣性遺伝形式で、完全欠損型はT- B- NK+ SCIDを、部分的欠損型はオーメン症候群を引き起こします。オーメン症候群では、剥脱性皮膚炎、紅皮症、脱毛症、リンパ節腫脹、好酸球増多症、血清IgE高値などを呈します。

・TTC7A遺伝子：
テトラトリコペプチドリピート含有タンパク質7Aをコードする遺伝子。腸管上皮のバリア機能とリンパ球の発達に関与します。常染色体劣性遺伝形式で、重度の腸疾患（多発性腸閉鎖、炎症性腸疾患様の症状）を伴うSCIDの原因となります。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、13の原因遺伝子のみを対象としています。B細胞陰性重症複合免疫不全症には他にも原因遺伝子が存在する可能性があります。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。また、X連鎖型SCID（IL2RG遺伝子変異）やその他のB細胞陽性型SCIDは、このパネルには含まれていません。