運動失調症遺伝子検査パネル検査｜ミネルバクリニック

ABCB7, ABHD12, ACO2, AFG3L2, AHI1, ALDH5A1, ALS2, ANO10, APTX, ARL13B, ASAH1, ATCAY, ATL1, ATM, ATP7A, ATP8A2, B9D1, BBS1, BBS12, BSCL2, C12orf65, C19orf12, CA8, CACNA1A, CACNB4, CAMTA1, CC2D2A, CCDC88C, CEP290, CEP41, CLCN2, CLN5, CLPP, COQ2, COQ6, COQ8A, COQ9, COX20, CPLANE1, CSTB, CWF19L1, CYP27A1, CYP7B1, DNAJC19, DNMT1, EEF2, EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4, EIF2B5, ELOVL4, ELOVL5, FA2H, FBXL4, FGF14, FLVCR1, FMR1, FXN, GALC, GBA2, GFAP, GJC2, GOSR2, GRID2, GRM1, GSS, HEPACAM, INPP5E, ITM2B, ITPR1, KCNA1, KCNC3, KCND3, KCNJ10, KIF1A, KIF1C, KIF5A, KIF7, LAMA1, MLC1, MRE11, MTPAP, NDUFS1, NDUFS7, NOL3, NOTCH3, OFD1, OPA1, OPA3, OPHN1, PAX6, PDSS1, PDSS2, PDYN, PEX10, PEX7, PHYH, PLP1, PNKD, PNKP, PNPLA6, POLG, POLR3A, POLR3B, PRKCG, PRRT2, RORA, RPGRIP1L, RRM2B, RUBCN, SACS, SETX, SIL1, SLC16A2, SLC1A3, SLC2A1, SLC52A2, SLC52A3, SLC9A6, SNX14, SPAST, SPG11, SPG7, SPR, SPTBN2, STUB1, SYNE1, SYT14, TCTN1, TCTN2, TCTN3, TDP1, TGM6, TMEM216, TMEM231, TMEM237, TMEM240, TMEM67, TPP1, TTBK2, TTPA, TUBB4A, TWNK, TYMP, VAMP1, VLDLR, WASHC5, WDR73, WDR81, WFS1, WWOX, ZNF423 ( 153遺伝子 )

遺伝子特記事項：
FXN遺伝子：FXN遺伝子で最も一般的な疾患関連変異は、GAA三塩基反復配列の伸長です。このパネル検査では、FXN遺伝子の塩基配列の変異とコピー数の変化のみを検査します。上記に特に記載がない限り、反復伸長の検査は含まれません。患者さんの臨床症状がこの遺伝子に関連する疾患（フリードライヒ運動失調症）に特異的である場合は、別途反復伸長検査が必要となる可能性があります。

このパネルに含まれる主要な疾患と遺伝子の例：
・脊髄小脳失調症（SCA）関連遺伝子：CACNA1A（SCA6）、PRKCG（SCA14）、ITPR1（SCA15/16）など
・常染色体劣性運動失調症：SACS（ARSACS）、APTX（AOA1）、SETX（AOA2）など
・エピソード性運動失調症：KCNA1（EA1）、CACNA1A（EA2）
・Joubert症候群関連遺伝子：AHI1、CC2D2A、CEP290、TMEM216など
・Bardet-Biedl症候群関連遺伝子：BBS1、BBS12など
・ミトコンドリア関連運動失調症：POLG、TWNK、COQ2など
・その他の症候群性運動失調症関連遺伝子

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※重要：この検査パネルには反復伸長解析は含まれていません。多くの脊髄小脳失調症（SCA1、SCA2、SCA3、SCA6、SCA7、SCA8、SCA10、SCA12、SCA17、SCA31、SCA36など）やフリードライヒ運動失調症、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症（DRPLA）などは、三塩基反復配列やその他の反復配列の異常拡大により発症します。これらの疾患が臨床的に疑われる場合は、別途「運動失調症リピート伸長解析」の検査が必要です。