アルツハイマー・認知症NGS遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

APOE, APP, C9orf72, CSF1R, DNMT1, EIF4G1, GBA, GRN, MAPT, PRNP, PSEN1, PSEN2, SNCA, SNCB, TREM2, TYROBP ( 16遺伝子 )

各遺伝子の詳細：

・APP遺伝子（アミロイド前駆体タンパク質）：
家族性アルツハイマー病の原因遺伝子の一つ。APP遺伝子の変異により、アミロイドβの産生が増加し、早期発症のアルツハイマー病を引き起こす。常染色体優性遺伝形式をとり、変異保有者はほぼ100％の確率で発症する。

・PSEN1遺伝子（プレセニリン1）：
家族性アルツハイマー病の最も頻度の高い原因遺伝子。PSEN1遺伝子の変異により、アミロイドβの産生が増加し、非常に早期（20歳代後半～50歳代）にアルツハイマー病を発症する。常染色体優性遺伝形式をとる。

・PSEN2遺伝子（プレセニリン2）：
家族性アルツハイマー病の原因遺伝子の一つ。PSEN1と同様の機能を持ち、変異によりアミロイドβの産生が増加する。PSEN1よりも頻度は低いが、常染色体優性遺伝形式をとる。

・APOE遺伝子（アポリポタンパク質E）：
遅発性（老年性）アルツハイマー病の最も強力なリスク遺伝子。ε4型を持つ人は発症リスクが高くなる。ε4を1つ持つと3～4倍、2つ持つと約10倍のリスク増加。ただし、ε4を持っていても必ず発症するわけではない。

・MAPT遺伝子（微小管結合タンパク質タウ）：
前頭側頭型認知症の原因遺伝子の一つ。タウタンパク質の異常により、神経細胞の変性と認知機能障害を引き起こす。行動異常や人格変化を伴うことが特徴。

・GRN遺伝子（プログラニュリン）：
前頭側頭型認知症の原因遺伝子の一つ。GRN遺伝子の変異により、プログラニュリンタンパク質の機能低下が生じ、前頭側頭型認知症を発症する。常染色体優性遺伝形式をとる。

・C9orf72遺伝子：
前頭側頭型認知症および筋萎縮性側索硬化症（ALS）の最も頻度の高い原因遺伝子。遺伝子内のヘキサヌクレオチドリピートの異常伸長により発症する。当検査ではリピートプライムドPCR（rpPCR）法によりリピート伸長を検出する。

・SNCA遺伝子（αシヌクレイン）：
パーキンソン病およびレビー小体型認知症の原因遺伝子。αシヌクレインの蓄積により、レビー小体が形成され、神経細胞の変性を引き起こす。

・SNCB遺伝子（βシヌクレイン）：
パーキンソン病やレビー小体型認知症のリスク遺伝子として同定されている。αシヌクレインと相互作用し、神経変性に関与する。

・GBA遺伝子（グルコセレブロシダーゼ）：
パーキンソン病およびレビー小体型認知症の強力なリスク遺伝子。ゴーシェ病の原因遺伝子でもあるが、GBA遺伝子変異保有者はパーキンソン病の発症リスクが高い。

・PRNP遺伝子（プリオン蛋白）：
クロイツフェルト・ヤコブ病などのプリオン病の原因遺伝子。急速進行性の認知症を引き起こす。家族性プリオン病は常染色体優性遺伝形式をとる。

・CSF1R遺伝子（コロニー刺激因子1受容体）：
遺伝性びまん性白質脳症を伴う脳症（HDLS）の原因遺伝子。成人発症の進行性認知症と運動機能障害を引き起こす。常染色体優性遺伝形式をとる。

・TREM2遺伝子（骨髄系細胞に発現する2型トリガー受容体）：
遅発性アルツハイマー病のリスク遺伝子として近年注目されている。ミクログリア（脳の免疫細胞）の機能に関与し、変異により認知症リスクが上昇する。

・TYROBP遺伝子（TREM2結合タンパク質）：
TREM2と協調して働く遺伝子。脳内の炎症反応や免疫応答に関与し、認知症のリスクに影響する。

・EIF4G1遺伝子（真核生物翻訳開始因子4ガンマ1）：
パーキンソン病および認知症のリスク遺伝子。タンパク質合成の制御に関与する。

・DNMT1遺伝子（DNAメチルトランスフェラーゼ1）：
遺伝性感覚性・自律神経性ニューロパチーを伴う認知症の原因遺伝子。DNAメチル化の異常により神経変性を引き起こす。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。C9orf72遺伝子のリピート伸長はリピートプライムドPCR（rpPCR）法により検査しますが、C9orf72メチル化研究は含まれません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※APOE遺伝子については、リスク遺伝子としての検査結果が得られますが、APOE遺伝子型だけでアルツハイマー病の発症を確定診断することはできません。リスク評価の一つの指標として用いられます。