思春期・成人発症てんかん遺伝子検査（NGSパネル）｜ミネルバクリニック

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各遺伝子カテゴリーの詳細：

■イオンチャネル遺伝子（17遺伝子）

・ナトリウムチャネル：
SCN5A遺伝子：心筋型ナトリウムチャネルをコードします。変異により、Brugada症候群や夜間前頭葉てんかんとの関連が報告されています。

・カリウムチャネル：
KCNA1遺伝子：電位依存性カリウムチャネルをコードし、発作性運動失調とてんかんを引き起こします。
KCNC1遺伝子：電位依存性カリウムチャネルをコードし、進行性ミオクローヌスてんかんの原因となります。

・カルシウムチャネル：
CACNA1A遺伝子：P/Q型カルシウムチャネルをコードし、欠神てんかんや片麻痺性片頭痛の原因となります。
CACNA1H遺伝子：T型カルシウムチャネルをコードし、特発性全般てんかんに関連します。
CACNB4遺伝子：カルシウムチャネルβサブユニットをコードし、若年性ミオクローヌスてんかんに関連します。

・塩素チャネル：
CLCN2遺伝子：塩素チャネルをコードし、特発性全般てんかんに関連します。
CLCN4遺伝子：X連鎖性の塩素チャネルをコードし、知的障害とてんかんを引き起こします。

・その他のチャネル関連：
ATP1A2遺伝子：Na+/K+-ATPアーゼをコードし、家族性片麻痺性片頭痛とてんかんに関連します。
ATP2A2遺伝子：筋小胞体Ca2+-ATPアーゼをコードし、発作を伴うことがあります。
CASR遺伝子：カルシウム感知受容体をコードし、低カルシウム血症性発作に関連します。

■神経伝達物質受容体遺伝子（8遺伝子）

・GABA受容体：
GABRA1遺伝子：GABAA受容体α1サブユニットをコードし、若年性ミオクローヌスてんかんに関連します。
GABRD遺伝子：GABAA受容体δサブユニットをコードし、全般てんかんに関連します。
GABRG2遺伝子：GABAA受容体γ2サブユニットをコードし、小児欠神てんかんや熱性けいれんに関連します。

・ニコチン性アセチルコリン受容体：
CHRNA2遺伝子：ニコチン性アセチルコリン受容体α2サブユニットをコードし、常染色体優性夜間前頭葉てんかんに関連します。
CHRNA4遺伝子：ニコチン性アセチルコリン受容体α4サブユニットをコードし、最も頻度の高い常染色体優性夜間前頭葉てんかんの原因です。
CHRNB2遺伝子：ニコチン性アセチルコリン受容体β2サブユニットをコードし、夜間前頭葉てんかんに関連します。

・グルタミン酸受容体：
GRIA3遺伝子：AMPA型グルタミン酸受容体をコードし、X連鎖性知的障害とてんかんに関連します。

・その他の受容体：
ADRA2B遺伝子：α2アドレナリン受容体をコードし、発作閾値に影響を与えます。

■代謝関連遺伝子（27遺伝子）

・ライソゾーム蓄積症関連：
AGA遺伝子：アスパルチルグルコサミニダーゼをコードし、アスパルチルグルコサミン尿症の原因となります。
ARG1遺伝子：アルギナーゼをコードし、高アルギニン血症の原因となります。
ARSA遺伝子：アリールスルファターゼAをコードし、異染性白質ジストロフィーの原因となります。
ARSB遺伝子：アリールスルファターゼBをコードし、ムコ多糖症VI型の原因となります。
ASAH1遺伝子：酸性セラミダーゼをコードし、ファーバー病の原因となります。
BTD遺伝子：ビオチニダーゼをコードし、ビオチニダーゼ欠損症の原因となります。発作を伴うことが多いです。
CTSA遺伝子：カテプシンAをコードし、ガラクトシアリドーシスの原因となります。
CTSF遺伝子：カテプシンFをコードし、セロイドリポフスチン症8型の原因となります。
GBA遺伝子：グルコセレブロシダーゼをコードし、ゴーシェ病の原因となります。
GLB1遺伝子：β-ガラクトシダーゼをコードし、GM1ガングリオシドーシスの原因となります。
GNS遺伝子：N-アセチルグルコサミン-6-スルファターゼをコードし、ムコ多糖症IIID型の原因となります。
HEXA遺伝子：ヘキソサミニダーゼAをコードし、テイ・サックス病の原因となります。
HGSNAT遺伝子：ヘパラン-α-グルコサミニドN-アセチルトランスフェラーゼをコードし、ムコ多糖症IIIC型の原因となります。
NAGLU遺伝子：α-N-アセチルグルコサミニダーゼをコードし、サンフィリポ症候群B型の原因となります。
NEU1遺伝子：シアリダーゼをコードし、シアリドーシスの原因となります。
NPC1遺伝子：ニーマン・ピック病C1タンパク質をコードし、ニーマン・ピック病C型の原因となります。
NPC2遺伝子：ニーマン・ピック病C2タンパク質をコードし、ニーマン・ピック病C型の原因となります。
PANK2遺伝子：パントテン酸キナーゼ2をコードし、神経変性症とてんかんを伴います。
PPT1遺伝子：パルミトイルプロテインチオエステラーゼをコードし、セロイドリポフスチン症1型の原因となります。
SCARB2遺伝子：リソソーム膜タンパク質をコードし、進行性ミオクローヌスてんかんの原因となります。
VPS13A遺伝子：バキュオラー分別タンパク質をコードし、舞踏病とてんかんを伴います。

・その他の代謝関連：
AMACR遺伝子：α-メチルアシル-CoAラセマーゼをコードし、成人発症の感覚運動神経障害とてんかんに関連します。
L2HGDH遺伝子：L-2-ヒドロキシグルタル酸デヒドロゲナーゼをコードし、L-2-ヒドロキシグルタル酸尿症の原因となります。
PDHA1遺伝子：ピルビン酸デヒドロゲナーゼE1αサブユニットをコードし、ピルビン酸デヒドロゲナーゼ欠損症の原因となります。
PEX7遺伝子：ペルオキシソーム生合成因子をコードし、レフサム病の原因となります。
SLC19A3遺伝子：チアミントランスポーターをコードし、チアミン代謝異常によるてんかんを引き起こします。
SLC25A15遺伝子：オルニチントランスロカーゼをコードし、高オルニチン血症・高アンモニア血症・ホモシトルリン尿症症候群の原因となります。
SLC6A8遺伝子：クレアチントランスポーターをコードし、X連鎖性クレアチン欠乏症候群の原因となります。

■神経発達・構造関連遺伝子（22遺伝子）

・細胞骨格・構造：
FLNA遺伝子：フィラミンAをコードし、脳室周囲結節性異所性灰白質とてんかんの原因となります。
GFAP遺伝子：グリア線維性酸性タンパク質をコードし、アレキサンダー病の原因となります。
ASPM遺伝子：異常紡錘体様小頭症関連タンパク質をコードし、小頭症とてんかんを引き起こします。
ATRX遺伝子：α-サラセミア/知的障害症候群X連鎖タンパク質をコードし、重度知的障害とてんかんを引き起こします。
CUL4B遺伝子：カリンファミリータンパク質をコードし、X連鎖性知的障害とてんかんを引き起こします。

・神経細胞移動・配置：
ARL13B遺伝子：ARLファミリータンパク質をコードし、ジュベール症候群とてんかんに関連します。
CC2D2A遺伝子：コイルドコイルおよびC2ドメイン含有タンパク質をコードし、ジュベール症候群に関連します。
CENPJ遺伝子：セントロソームタンパク質をコードし、小頭症とてんかんを引き起こします。
CEP290遺伝子：セントロソームタンパク質をコードし、ジュベール症候群に関連します。
GLI3遺伝子：GLI転写因子をコードし、形成異常とてんかんに関連します。
OFD1遺伝子：口腔・顔面・指症候群タンパク質をコードし、ジュベール症候群に関連します。
RELN遺伝子：リーリンをコードし、滑脳症とてんかんの原因となります。
RBFOX1遺伝子：RNAスプライシング因子をコードし、てんかんと神経発達障害に関連します。
RBFOX3遺伝子：RNAスプライシング因子をコードし、てんかんに関連します。

・シナプス関連：
ARFGEF2遺伝子：ARFグアニンヌクレオチド交換因子をコードし、小頭症とてんかんを引き起こします。
CASK遺伝子：カルシウム/カルモジュリン依存性セリンプロテインキナーゼをコードし、X連鎖性知的障害とてんかんを引き起こします。
CNTN2遺伝子：コンタクチン2をコードし、皮質形成異常とてんかんに関連します。
IQSEC2遺伝子：IQモチーフおよびSecドメイン含有タンパク質をコードし、X連鎖性知的障害とてんかんを引き起こします。
LGI1遺伝子：ロイシンリッチグリオーマ不活性化タンパク質をコードし、常染色体優性側頭葉てんかんの原因となります。
PURA遺伝子：プリンリッチエレメント結合タンパク質をコードし、発達遅滞とてんかんを引き起こします。
SMARCA2遺伝子：クロマチンリモデリング因子をコードし、ニコライデス・バライツァー症候群とてんかんの原因となります。

■てんかん症候群特異的遺伝子（6遺伝子）

EPM2A遺伝子：ラフォリン（デュアル特異性ホスファターゼ）をコードし、ラフォラ病（進行性ミオクローヌスてんかん）の原因となります。
NHLRC1遺伝子：マリンをコードし、ラフォラ病の原因となります。
DEPDC5遺伝子：mTOR経路調節タンパク質をコードし、家族性焦点てんかんの最も頻度の高い原因です。
DNAJC5遺伝子：シスチン弦タンパク質αをコードし、成人型セロイドリポフスチン症の原因となります。
EFHC1遺伝子：EFハンドドメイン含有タンパク質をコードし、若年性ミオクローヌスてんかんに関連します。
RAI1遺伝子：レチノイン酸誘導タンパク質をコードし、スミス・マゲニス症候群とてんかんを引き起こします。

■血管・結合組織関連遺伝子（2遺伝子）

NOTCH3遺伝子：Notch3受容体をコードし、CADASIL（脳動脈症）とてんかんに関連します。
COL4A1遺伝子：IV型コラーゲンα1鎖をコードし、脳小血管症とてんかんに関連します。

■その他の重要な遺伝子（8遺伝子）

ATP6V0A2遺伝子：液胞型H+-ATPアーゼをコードし、グリコシル化異常症とてんかんを引き起こします。
BRAF遺伝子：セリン/トレオニンキナーゼをコードし、神経皮膚黒色症とてんかんに関連します。
C12orf57遺伝子：機能不明のタンパク質をコードし、てんかん性脳症に関連します。
CPA6遺伝子：カルボキシペプチダーゼAをコードし、熱性けいれんとてんかんに関連します。
CRH遺伝子：コルチコトロピン放出ホルモンをコードし、熱性けいれんに関連します。
GRN遺伝子：プログラニュリンをコードし、前頭側頭型認知症とてんかんに関連します。
NF1遺伝子：ニューロフィブロミンをコードし、神経線維腫症1型とてんかんに関連します。
SERPINI1遺伝子：神経セルピンをコードし、家族性脳症とてんかんの原因となります。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、84の原因遺伝子のみを対象としています。てんかんは遺伝学的に非常に多様性が高い疾患であり、現在も新しい原因遺伝子が次々と発見されています。また、多くのてんかん症例では遺伝的原因が複雑で、複数の遺伝子や環境要因が関与していることがあります。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。