アクショナブルてんかんNGSパネル検査｜ミネルバクリニック

ADRA2B, ALDH7A1, ATP7A, FOLR1, GAMT, GATM, KCNQ2, KCNQ3, KCNT1, MECP2, PCDH19, PNPO, POLG, PRRT2, QDPR, SCN1A, SCN2A, SCN8A, SLC19A3, SLC2A1, SLC6A8, STXBP1, TPP1, TSC1, TSC2 ( 25遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・ADRA2B遺伝子：
アドレナリンα2B受容体をコードする遺伝子。

・ALDH7A1遺伝子：
アルデヒド脱水素酵素7A1をコードする遺伝子。ピリドキシン依存性てんかんの原因となり、ビタミンB6治療が有効です。

・ATP7A遺伝子：
銅輸送ATPアーゼをコードする遺伝子。X連鎖遺伝形式をとり、メンケス病に関連します。

・FOLR1遺伝子：
葉酸受容体1をコードする遺伝子。脳葉酸欠乏症の原因となり、葉酸補充療法が有効です。

・GAMT遺伝子：
グアニジノ酢酸メチル基転移酵素をコードする遺伝子。クレアチン欠乏症候群の原因となります。

・GATM遺伝子：
グリシンアミジノトランスフェラーゼをコードする遺伝子。クレアチン合成に関与します。

・KCNQ2遺伝子：
カリウムチャネルKv7.2をコードする遺伝子。良性家族性新生児けいれんおよび乳児てんかん性脳症の原因となります。

・KCNQ3遺伝子：
カリウムチャネルKv7.3をコードする遺伝子。KCNQ2と同様に新生児けいれんの原因となります。

・KCNT1遺伝子：
ナトリウム活性化カリウムチャネルをコードする遺伝子。睡眠関連過運動性てんかんや遊走性焦点発作の原因となります。

・MECP2遺伝子：
メチルCpG結合タンパク質2をコードする遺伝子。レット症候群の原因で、女児に多く、発達退行とてんかんを伴います。X連鎖優性遺伝形式をとります。

・PCDH19遺伝子：
プロトカドヘリン19をコードする遺伝子。女性に限定されたてんかんと精神遅滞の原因となります。X連鎖遺伝形式をとります。

・PNPO遺伝子：
ピリドックス(アミン)5′-リン酸酸化酵素をコードする遺伝子。ピリドキサールリン酸依存性てんかんの原因で、ビタミンB6治療が有効です。

・POLG遺伝子：
DNAポリメラーゼγをコードする遺伝子。ミトコンドリア病に関連し、アルパース・フッテンロッハ症候群の原因となります。

・PRRT2遺伝子：
プロリンリッチ膜貫通タンパク質2をコードする遺伝子。良性家族性乳児けいれんの最も頻度の高い原因遺伝子です。

・QDPR遺伝子：
ジヒドロプテリジン還元酵素をコードする遺伝子。高フェニルアラニン血症に関連します。

・SCN1A遺伝子：
ナトリウムチャネルNav1.1をコードする遺伝子。ドラベ症候群（重症乳児ミオクロニーてんかん）の主要な原因遺伝子です。

・SCN2A遺伝子：
ナトリウムチャネルNav1.2をコードする遺伝子。乳児てんかん性脳症および良性家族性新生児乳児けいれんの原因となります。

・SCN8A遺伝子：
ナトリウムチャネルNav1.6をコードする遺伝子。早期乳児てんかん性脳症の原因となります。

・SLC19A3遺伝子：
チアミントランスポーターをコードする遺伝子。チアミン代謝機能不全症候群2型の原因となります。

・SLC2A1遺伝子：
グルコーストランスポーター1（GLUT1）をコードする遺伝子。GLUT1欠損症候群の原因で、ケトン食療法が極めて有効です。

・SLC6A8遺伝子：
クレアチントランスポーターをコードする遺伝子。X連鎖性のクレアチン欠乏症候群の原因となります。

・STXBP1遺伝子：
シンタキシン結合タンパク質1をコードする遺伝子。ウエスト症候群や早期乳児てんかん性脳症の原因となります。

・TPP1遺伝子：
トリペプチジルペプチダーゼ1をコードする遺伝子。神経セロイドリポフスチン症2型（CLN2病）の原因で、酵素補充療法が利用可能です。

・TSC1遺伝子：
ハマルチン（hamartin）をコードする遺伝子。結節性硬化症の原因遺伝子の一つで、てんかんを高頻度に合併します。

・TSC2遺伝子：
チューベリン（tuberin）をコードする遺伝子。結節性硬化症の原因遺伝子で、TSC1よりも重症例が多いです。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、25の原因遺伝子のみを対象としています。てんかんの原因遺伝子は100個を超えると推定されており、本パネルに含まれない遺伝子による発症の可能性もあります。検査で病原性変異が検出されなくても、遺伝性てんかんを完全に否定することはできません。