1色覚（全色盲）NGS遺伝子検査パネル｜ミネルバクリニック

CNGA3, CNGB3, GNAT2, PDE6C ( 4遺伝子 )

各遺伝子の詳細：
・CNGA3遺伝子：
第2染色体（2q11.2）に位置し、環状ヌクレオチド依存性陽イオンチャネルα3サブユニット（Cyclic Nucleotide Gated Channel Alpha 3）をコードする遺伝子。錐体細胞において、光刺激によって生じた環状GMPに応答してイオンチャネルを開き、細胞の脱分極を引き起こす重要な役割を果たします。CNGA3遺伝子の変異は1色覚（全色盲）の約25％を占め、Achromatopsia 2型（ACHM2）として分類されます。

・CNGB3遺伝子：
第8染色体（8q21.3）に位置し、環状ヌクレオチド依存性陽イオンチャネルβ3サブユニット（Cyclic Nucleotide Gated Channel Beta 3）をコードする遺伝子。CNGA3と共同してヘテロ四量体チャネルを形成し、錐体細胞の光伝達に必須です。CNGB3遺伝子の変異は1色覚（全色盲）の最も頻度の高い原因で、全症例の約50％を占めます。Achromatopsia 3型（ACHM3）として分類され、特定の変異（c.1148delC）がヨーロッパ系集団で高頻度に見られます。ピンゲラップ島で高頻度の創始者変異（p.Ser435Phe）もCNGB3遺伝子に存在します。

・GNAT2遺伝子：
第1染色体（1p13.3）に位置し、錐体細胞特異的なトランスデューシンα2サブユニット（Guanine Nucleotide Binding Protein Alpha Transducing 2）をコードする遺伝子。光受容体で光が吸収されると活性化され、下流のホスホジエステラーゼを活性化することで環状GMPの濃度を低下させ、光信号を増幅する役割を果たします。GNAT2遺伝子の変異は1色覚（全色盲）の約2〜10％を占め、Achromatopsia 4型（ACHM4）として分類されます。多くの変異は切断型の非機能性タンパク質を産生します。

・PDE6C遺伝子：
第10染色体（10q24.32）に位置し、錐体細胞特異的なホスホジエステラーゼ6Cサブユニット（Phosphodiesterase 6C）をコードする遺伝子。トランスデューシンによって活性化され、環状GMPを分解することで錐体細胞の光応答を制御します。PDE6C遺伝子の変異は1色覚（全色盲）の約1〜2％を占め、Achromatopsia 5型（ACHM5）として分類されます。比較的稀な原因遺伝子ですが、特定の集団では高頻度に見られる創始者変異が報告されています。

すべての配列決定技術には限界があります。この分析は次世代シーケンシング（NGS）により実施され、コード領域とスプライス接合部の検査を目的として設計されています。次世代シーケンシング技術と当院のバイオインフォマティクス分析により、偽遺伝子配列やその他の高度に相同な配列の寄与は大幅に減少しますが、これらは配列決定および欠失/重複分析の両方において病原性変異体対立遺伝子を同定するアッセイの技術的能力を時に妨げる可能性があります。

低品質スコアの変異確認および被覆標準を満たすためにサンガー配列決定が使用されます。注文された場合、欠失/重複分析は、１つの完全な遺伝子（頬粘膜スワブ検体および全血検体）および2つ以上の連続するエキソンサイズ（全血検体のみ）のゲノム領域の変化を同定できます。単一エキソンの欠失または重複が時に同定される場合がありますが、この検査では日常的に検出されません。同定された推定欠失または重複は、直交法（qPCRまたはMLPA）により確認されます。

この検査では、疾患を引き起こす可能性がある特定のタイプのゲノム変化は検出されません。これには、転座や逆位、反復伸長（例：三塩基またはヘキサ塩基）、ほとんどの調節領域（プロモーター領域）または深部イントロン領域（エキソンから20bp以上）の変化が含まれますが、これらに限定されません。この検査は体細胞モザイクまたは体細胞変異の検出を目的として設計または検証されていません。

※この検査パネルでは、4つの主要原因遺伝子のみを対象としています。その他の稀な原因遺伝子（ATF6、PDE6Hなど）による1色覚（全色盲）は検出できません。また、約20〜30％の1色覚（全色盲）症例では、既知の遺伝子に変異が見つかりません。検査で病原性変異が検出されなくても、疾患を完全に否定することはできません。