
コドンのウォブルポジションwobble positionとは、コドンの3番目のヌクレオチドのことを指します。この位置のヌクレオチドは2つの重要な特徴を持っています。
まず、コドンの3番目の位置にあるヌクレオチドは、mRNAのコドンとそれに対応するtRNAの結びつきが緩いため、通常のグアニンとシトシン、アデニンとチミンとは異なる種類の塩基対が形成されることがあります。
さらに、遺伝暗号には冗長性があり、異なるコドンが同じアミノ酸を指示することがあります。この冗長性は、特にコドンの3番目の位置で見られ、最初の2つのヌクレオチドが同じである場合、3番目のヌクレオチドが異なっていても同じアミノ酸をコードすることが多いのです。

コドンのウォブルポジションとは、tRNAのアンチコドンとmRNAのコドンが対合する際に、アンチコドンの第一塩基(コドンの第三塩基に対応する)が通常の塩基対形成の規則から逸脱して、複数の異なる塩基と対合できる現象を指します[5][6][7]. この「ウォブル」の原則により、tRNAはコドンの第三塩基に対して柔軟性を持ち、限られた数のtRNAで多様なコドンを認識し、アミノ酸を適切に組み込むことが可能になります。
例えば、アンチコドンのウリジン(U)は、コドンのアデニン(A)やグアニン(G)とも対合することができます。このようなウォブル対合は、特にミトコンドリアのtRNAで顕著であり、限られた種類のtRNAで全てのコドンを解読するために要です[7]. また、ウォブルポジションにおける塩基の修飾も、コドンとの対合の性質を変化させ、コドン選択性に影響を与えることが指摘されています[1][6].
[1] www.nig.ac.jp/museum/evolution04.html
[5] www.ach.ehime-u.ac.jp/seminar/gist/98_1.pdf
[6] www.jstage.jst.go.jp/article/vivaorigino/42/4/42_47/_pdf
[7] gakui.dl.itc.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/gazo.cgi?no=114331



