KMT5B遺伝子
遺伝子名: lysine methyltransferase 5B
別名: CGI-85, CGI85, SUV420H1
染色体: 11
遺伝子座: 11q13.2
遺伝カテゴリー: Rare Single Gene variant–Syndromic
関連する疾患：Mental retardation, autosomal dominant 51
機能
KMT5B遺伝子がコードするのはヒストンH4の「Lys-20」を特異的にトリメチル化するヒストン・メチルトランスフェラーゼ。H4の「Lys-20」のトリメチル化は、エピジェネティックな転写抑制のための特異的なタグとなる。主にヘテロクロマチン周辺領域で機能し、ヘテロクロマチンが構成的に確立される際に中心的な役割を果たしている。KMT5Bは、RB1ファミリータンパク質（RB1、RBL1、RBL2）との相互作用を介して、ヒストンH3を標的としている。EID3などの標的遺伝子の発現を制御することにより、筋形成に関与している。
発現
Twellsら(2001)は、11番染色体のIDDM4(600319)領域の塩基配列を決定した後、データベース解析を行い、SUV420H1をクローニングし、CGI85と命名した。このタンパク質は384個のアミノ酸を含んでいます。
Schottaら（2004）は、マウスのSuv420h1をクローニングした。この876アミノ酸のタンパク質は、N-末端のSETドメインと、他の種のSuv420hオルソログに保存されている3つの追加領域を含む。蛍光タグ付きのSuv420h1は、トランスフェクトしたマウス胚性線維芽細胞（MEF）のヘテロクロマチン周囲に局在していた。
自閉症スペクトラムASDとの関係
Iossifov et al., 2012 (PMID 22542183)では、シンプレックス家系の自閉症患者において、KMT5B遺伝子の機能低下型（旧称：SUV420H1）が発見されました。また、Sanders et al., 2012 (PMID 22495306)では、Simons Simplex CollectionのASD患者に、KMT5B遺伝子の2つのミスセンスバリアントが同定されましたが、これは劇症型と予測されます。母集団の割合は示されていませんが、この遺伝子のNHLBI Exome Sequencing ProjectのExome Variant Viewerには多くのミスセンスバリアントが掲載されています。De Rubeis et al., 2014 (PMID 25363760)では、Autism Sequencing ConsortiumのASDプロバンドにおいて、さらに2つの本遺伝子のde novo LoFバリアントが同定されました。この報告では、Autism Sequencing Consortium (ASC)のASD症例3,871人と先祖を一致させたまたは父方のコントロール9,937人を対象とした希少なコーディングバリエーションの解析により、KMT5BがFDR 0.01で高い統計的有意性を満たす遺伝子、つまりこの遺伝子が真の自閉症遺伝子である可能性が99%であることが確認されました(PMID 25363760)。この遺伝子は、Iossifovらが2015年に、de novo変異の証拠と、コントロールにおける変異の不在または非常に低い頻度の組み合わせに基づいて、ASDリスク遺伝子の有力な候補として同定しました(PMID 26401017)。KMT5Bの追加のde novo変異がASDおよび/または発達遅延/知的障害のある人で同定されています(Stessman et al., 2017; Yuen et al., 2017)。
プロフィール
この記事の筆者：仲田洋美（医師）
