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KMT5B遺伝子

KMT5B遺伝子

遺伝子名: lysine methyltransferase 5B
別名: CGI-85, CGI85, SUV420H1
染色体: 11
遺伝子座: 11q13.2
遺伝カテゴリー: Rare Single Gene variant–Syndromic
関連する疾患:Mental retardation, autosomal dominant 51

https://omim.org/entry/610881

機能

KMT5B遺伝子がコードするのはヒストンH4の「Lys-20」を特異的にトリメチル化するヒストン・メチルトランスフェラーゼ。H4の「Lys-20」のトリメチル化は、エピジェネティックな転写抑制のための特異的なタグとなる。主にヘテロクロマチン周辺領域で機能し、ヘテロクロマチンが構成的に確立される際に中心的な役割を果たしている。KMT5Bは、RB1ファミリータンパク質(RB1、RBL1、RBL2)との相互作用を介して、ヒストンH3を標的としている。EID3などの標的遺伝子の発現を制御することにより、筋形成に関与している。

発現

Twellsら(2001)は、11番染色体のIDDM4(600319)領域の塩基配列を決定した後、データベース解析を行い、SUV420H1をクローニングし、CGI85と命名した。このタンパク質は384個のアミノ酸を含んでいます。

Schottaら(2004)は、マウスのSuv420h1をクローニングした。この876アミノ酸のタンパク質は、N-末端のSETドメインと、他の種のSuv420hオルソログに保存されている3つの追加領域を含む。蛍光タグ付きのSuv420h1は、トランスフェクトしたマウス胚性線維芽細胞(MEF)のヘテロクロマチン周囲に局在していた。

自閉症スペクトラムASDとの関係

Iossifov et al., 2012 (PMID 22542183)では、シンプレックス家系の自閉症患者において、KMT5B遺伝子の機能低下型(旧称:SUV420H1)が発見されました。また、Sanders et al., 2012 (PMID 22495306)では、Simons Simplex CollectionのASD患者に、KMT5B遺伝子の2つのミスセンスバリアントが同定されましたが、これは劇症型と予測されます。母集団の割合は示されていませんが、この遺伝子のNHLBI Exome Sequencing ProjectのExome Variant Viewerには多くのミスセンスバリアントが掲載されています。De Rubeis et al., 2014 (PMID 25363760)では、Autism Sequencing ConsortiumのASDプロバンドにおいて、さらに2つの本遺伝子のde novo LoFバリアントが同定されました。この報告では、Autism Sequencing Consortium (ASC)のASD症例3,871人と先祖を一致させたまたは父方のコントロール9,937人を対象とした希少なコーディングバリエーションの解析により、KMT5BがFDR 0.01で高い統計的有意性を満たす遺伝子、つまりこの遺伝子が真の自閉症遺伝子である可能性が99%であることが確認されました(PMID 25363760)。この遺伝子は、Iossifovらが2015年に、de novo変異の証拠と、コントロールにおける変異の不在または非常に低い頻度の組み合わせに基づいて、ASDリスク遺伝子の有力な候補として同定しました(PMID 26401017)。KMT5Bの追加のde novo変異がASDおよび/または発達遅延/知的障害のある人で同定されています(Stessman et al., 2017; Yuen et al., 2017)。

仲田洋美 医師(臨床遺伝専門医)

この記事の監修・執筆者:仲田 洋美

(臨床遺伝専門医/がん薬物療法専門医/総合内科専門医)

ミネルバクリニック院長。1995年に医師免許を取得後、 臨床遺伝学・内科学・腫瘍学を軸に診療を続けてきました。 のべ10万人以上のご家族の意思決定と向き合ってきた臨床遺伝専門医です。

出生前診断(NIPT・確定検査・遺伝カウンセリング)においては、 検査結果の数値そのものだけでなく、 「結果をどう受け止め、どう生きるか」までを医療の責任と捉え、 一貫した遺伝カウンセリングと医学的支援を行っています。

ハイティーンの時期にベルギーで過ごし、 日本人として異文化の中で生活した経験があります。 価値観や宗教観、医療への向き合い方が国や文化によって異なることを体感しました。 この経験は現在の診療においても、 「医学的に正しいこと」と「その人にとって受け止められること」の両立を考える姿勢の基盤となっています。

また、初めての妊娠・出産で一卵性双生児を妊娠し、 36週6日で一人を死産した経験があります。 その出来事は、妊娠・出産が女性の心身に与える影響の大きさ、 そして「トラウマ」となり得る体験の重みを深く考える契機となりました。 現在は、女性を妊娠・出産のトラウマから守る医療を使命の一つとし、 出生前診断や遺伝カウンセリングに取り組んでいます。

出生前診断は単なる検査ではなく、 家族の未来に関わる重要な意思決定です。 年齢や統計だけで判断するのではなく、 医学的根拠と心理的支援の両面から、 ご家族が後悔の少ない選択をできるよう伴走することを大切にしています。

日本人類遺伝学会認定 臨床遺伝専門医/日本内科学会認定 総合内科専門医/ 日本臨床腫瘍学会認定 がん薬物療法専門医。 2025年には APAC地域における出生前検査分野のリーダーとして国際的評価を受け、 複数の海外メディア・専門誌で特集掲載されました。

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