EHMT1遺伝子
遺伝子名;Euchromatic histone-lysine N-methyltransferase 1
別名:RP11-188C12.1, DKFZp667M072, EUHMTASE1, Eu-HMTase1, FLJ12879, FP13812, GLP, GLP1, KIAA1876, KMT1D, bA188C12.1
染色体番号: Chromosome No: 9
遺伝子座: 9q34.3
関連する疾患: Kleefstra syndrome
遺伝カテゴリー: Genetic Association-Rare Single Gene variant-Rare single gene variant/multigenic CNV-Rare single gene variant/Functional-Functional
機能
この遺伝子がコードするタンパク質は、転写を抑制するE2F6複合体の一部であるヒストンメチル化酵素である。このタンパク質は、MYC-およびE2F-応答性遺伝子のサイレンシングに関与している可能性があり、したがって、G0/G1細胞周期の移行に役割を果たしている可能性がある。この遺伝子の欠損は、9q染色体サブテロメリック欠失症候群(9q症候群)の原因となっている。
発現
Ogawaら(2002)は、転写を抑制するE2F6(602944)複合体の構成要素を明らかにした。E2F6複合体には、ヒストンアセチラーゼおよびデアセチラーゼ活性は検出されなかったが、メチルトランスフェラーゼ活性は検出された。Ogawaら(2002)は、E2F6複合体の構成要素として、ユークロマティックヒストン・メチルトランスフェラーゼ-1を同定した。1,267アミノ酸のEU-HMTase-1タンパク質は、アンキリンリピートとSETドメインを含んでいる。EU-HMTase-1は、NG36/G9A (604599)と63%の配列類似性を有していた。EU-HMTase-1はコアヒストンのヒストンH3に特異的なヒストンメチルトランスフェラーゼ活性を示したが、ヌクレオソームにはほとんどメチル化しなかったことから、ヌクレオソーム基質の修飾にはE2F6複合体の他のサブユニットが必要であることが示唆された。Ogawaら(2002)は、ヒストンH3のリジン-9がユークロマティック・ヒストン・メチルトランスフェラーゼ-1の標的であることを明らかにした。
自閉症スペクトラムASDとの関係
EHMT1遺伝子は、ASDの症例で遺伝子破壊につながるバランス型染色体異常(BCA)が確認されたことを受けて、ASDの候補遺伝子として同定された(Talkowskiら、2012年)。また、このBCAで破壊された遺伝子は、同じ報告書の追跡調査において、症例対照のCNV負担、または神経発達障害(NDD)の症例で最低3つのCNVが存在し、対照では存在しないことから、個別に関与していることが明らかになった。
その他の表現型
EHMT1の常染色体優性遺伝またはde novo変異は、知的障害、特徴的な顔貌、自閉症的特徴、睡眠障害、時に出生異常などの多くの重要な表現型を示すKleefstra症候群と関連している(PubMed: 20945554; OMIM: 610253)。EHMT1遺伝子の遺伝子産物は、Euchromatic histone lysine methyltransferase 1と呼ばれるタンパク質である。詳細はOMIM遺伝子エントリ EHMT1 (OMIM: 607001)を参照。