承認済シンボル:CTSD
遺伝子名:cathepsin D
参照:
HGNC: 2529
AllianceGenome : HGNC : 2529
NCBI:1509
Ensembl :ENSG00000117984
UCSC : uc001luc.2
遺伝子OMIM番号116840
●遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
●遺伝子のグループ:Cathepsins
Peptidase family A1
●遺伝子座: 11p15.5
●ゲノム座標: (GRCh38): 11:1,752,755-1,763,927
遺伝子の別名
cathepsin D preproprotein
ceroid-lipofuscinosis, neuronal 10
CLN10
CPSD
lysosomal aspartyl peptidase
lysosomal aspartyl protease
遺伝子の概要
CTSD遺伝子は、カテプシンDという酵素をコードするための指示を提供します。カテプシンDは、プロテアーゼ酵素の一つであり、リソソーム内でタンパク質を分解する役割を持っています。この酵素は細胞の多くの重要なプロセスに関与しており、タンパク質の分解、活性化、さらには細胞のプログラムされた死であるアポトーシスの調節にも影響を及ぼします。
カテプシンDは、不活性な前駆体形態であるプレプロ酵素として産生されます。この不活性形態から活性型への変換には、余分なタンパク質セグメントの除去とさらなる処理が必要です。このプロセスを通じて、成熟したカテプシンD酵素が形成され、これは軽鎖と重鎖の2つの部分から構成されています。
リソソーム内で活性化したカテプシンDは、さまざまなタンパク質を効率的に分解し、細胞内での物質のリサイクルに貢献します。また、この酵素は細胞の成長、分化、および死に関わるさまざまなシグナル経路を調節することで、細胞機能の維持と調整に重要な役割を果たします。
カテプシンDの機能不全は、アルツハイマー病やがんなど、多くの疾患の発症と関連していることが示されています。このため、カテプシンDは疾患の診断や治療のための標的として研究されています。
遺伝子の発現とクローニング
マッピング
これらの研究は、カテプシンDの正確な染色体位置の同定に大きく貢献しました。カテプシンDは、リソソーム酵素であり、タンパク質の分解に重要な役割を果たします。遺伝子マッピングによってその位置が明確になることで、遺伝性疾患や特定の病状との関連性を調査する際の出発点となります。このように、遺伝子の正確な位置を特定することは、基礎研究だけでなく、疾患の診断や治療法の開発にも重要な意味を持ちます。
遺伝子の機能
一方、Vitnerら(2010)は神経因性ゴーシェ病モデルマウスにおいて、カテプシンレベルと分布の有意な変化を観察しました。この研究では、カテプシンのmRNA発現、活性、タンパク質レベルが疾患の進行と相関して有意に上昇し、特に神経細胞の減少やアストログリオーシス、ミクログリオーシスが観察された領域でカテプシンDの上昇が確認されました。これらの結果から、カテプシンDがゴーシェ病のようなライソゾーム蓄積性疾患における神経病理学において重要な役割を担っていることが示唆されます。
Devosseら(2011)の研究では、精製した組み換えヒトHEBP1とカテプシンDの相互作用が解析され、カテプシンDがHEBP1を切断して機能的なF2Lペプチドを産生することが発見されました。この研究は、カテプシンDの機能がタンパク質分解に限定されないこと、そして特定のタンパク質と相互作用して特定の生理的プロセスを調節することができることを示しています。CTSDとHEBP1の高発現が肝臓、腎臓、脾臓で確認されたことは、これらの組織におけるHEBP1プロセシングにおけるCTSDの役割を支持します。
これらの研究から、カテプシンDが細胞内タンパク質輸送、特定疾患の病理学、および特定タンパク質のプロセシングにおいて多様な重要な役割を果たしていることが明らかになります。これらの知見は、カテプシンDを標的とした疾患治療戦略の開発において有用な情報を提供します。
分子遺伝学
Steinfeldらによる2006年の研究では、早期失明と進行性の精神運動障害を持つ小児(CLN10病; 610127)において、CTSD遺伝子のミスセンス変異(F229I, 116840.0001とW383C, 116840.0002)の複合ヘテロ接合が報告されました。これらの変異は、患者の線維芽細胞におけるカテプシンDの量の減少とタンパク質分解活性の著しい低下につながりました。特に、W383C変異は翻訳後のプロセシングと細胞内標的化を阻害し、F229I変異は酵素の最大速度を低下させることが明らかになりました。コンピューターモデリングにより、W383C変異がF229I変異よりも大きな構造変化を引き起こすことが示唆されました。
さらに、Siintolaらによる2006年の研究では、パキスタンの重度の先天性CLN10病を持つ幼児から、CTSD遺伝子にホモ接合性のヌル変異(116840.0003)が同定されました。これは、タンパク質が全く機能しないことを意味します。
2014年にはHershesonらが、若年発症のCLN10病を持つ4人のきょうだいから、CTSD遺伝子にホモ接合性のミスセンス変異(G149V; 116840.0004)を同定しました。この変異もまた、家族内での疾患と分離していました。血縁関係のないソマリア人の男児では、異なるホモ接合性のミスセンス変異(R399H; 116840.0005)が見つかりました。これらの患者の線維芽細胞では、カテプシンD活性の有意な低下が示され、コントロール値の11%に過ぎないことが報告されました。
これらの研究は、カテプシンDの欠損が致命的な神経変性疾患の原因となる可能性を示しており、特定の変異がこれらの症状の発現にどのように寄与しているかを理解する上で貴重な情報を提供しています。
動物モデル
これらの動物でパルミトイルタンパク質チオエステラーゼ活性が正常であることから、ヒトの小児神経性セロイドリポフスチン症とCONCLの分子基盤には違いがあることが示唆されました。リソソーム貯蔵病が疑われたため、Tyynelaらは様々なリソソーム酵素の活性を調べ、カテプシンDの活性がヘテロ接合体の子羊で正常の約40%にまで著しく低下していることを発見しました。すべての罹患動物でホモ接合状態で見られたヌクレオチド934のGからAへの転移は、アスパラギンからアスパラギン酸へのアミノ酸置換を引き起こしました。この変異は、ヒトのカテプシンD及びペプシンにおいて重要な位置に相当し、これらのアスパルチルプロテアーゼの触媒機能に必須なアスパラギン残基の1つを変更します。この残基は、すべてのアスパルチルプロテアーゼに保存されていることから、このタンパク質の機能において極めて重要な役割を果たしていることが示されています。
アレリックバリアント
.0001 セロイドリポフスチン症、神経細胞、10
CTSD, PH229ILE
カテプシンD欠損神経性セロイドリポフスチン症(CLN10; 610127)の患者において、Steinfeldら(2006)はCTSD遺伝子の変異の複合ヘテロ接合を発見した。母方の対立遺伝子では、エクソン5の6517T-A転換によりphe229-to-ile(F229I)置換が生じた。父方の対立遺伝子はエクソン9に10267G-Cの転座を有し、trp383からcysへの置換(W383C; 116840.0002)を生じた。カテプシンD前駆体タンパク質のF229I置換は成熟タンパク質のF165Iに相当する。Phe229はペプチダーゼのペプシンファミリーのメンバーの間で厳密に保存されている15アミノ酸のグループに属している。カテプシンD前駆体タンパク質のW383C置換は、成熟タンパク質のW319Cに相当する。Trp383は、12種のヒトのペプシン・ペプチダーゼのすべてと、このファミリーの他のほとんどすべての哺乳類のメンバーの間で保存されているが、より遠縁の種のペプシン・ペプチダーゼの中では保存されていない。
.0002 セロイドリポフスチン症、神経細胞、10
CTSD, TRP383CYS
Steinfeldら(2006)による、カテプシンD欠損神経性セロイドリポフスチン症(CLN10; 610127)患者において複合ヘテロ接合状態で発見されたCTSD遺伝子のtrp383-to-cys(W383C)変異についての考察は、116840.0001を参照。
.0003 セロイドリポフスチン症, 神経性, 10
ctsd, 1-bp dup, 764a
先天性神経性セロイドリポフスチン症-10(CLN10; 610127)を持つパキスタンの幼児において、Siintolaら(2006)はCTSD遺伝子のエクソン6に1bpの重複(764dupA)のホモ接合性を同定し、その結果、早発停止コドン(tyr255-to-ter; Y255X)、158アミノ酸のタンパク質の切断、および295位の活性部位アスパラギン酸残基の欠失をもたらした。この変異は550本の対照染色体では同定されなかった。ベビーハムスターの腎臓細胞を用いたin vitroの機能発現研究により、変異タンパク質は酵素活性を持たないことが示された。罹患していない父親はヘテロ接合体であった;父親の最初のいとこである母親のDNAは入手できなかった。同じ家族には他に2人の罹患した兄弟がいたが、彼らのDNAも入手できなかった。3人の男児は生後すぐに難治性のてんかん発作、痙縮、無呼吸を示した後、10歳、1歳、4日で死亡した。
.0004 セロイドリポフスチン症、神経細胞、10
CTSD, GLY149VAL
Hershesonら(2014)は、近親のソマリア人の両親から生まれた神経性セロイドリポフスチン症-10(CLN10;610127)の4人のきょうだいにおいて、CTSD遺伝子のエクソン4にホモ接合性の変異を同定し、その結果、高度に保存された残基でgly149からval(G149V)への置換が生じた。この変異は、ホモ接合性マッピングとエクソーム塩基配列決定の組み合わせによって同定され、家族内で本疾患と分離した。患者の線維芽細胞では、カテプシンD活性が有意に低下していた(コントロール値の11%)。患者は15歳頃に小脳失調と網膜色素変性症を呈し、進行すると著しい運動障害と認知機能低下をきたした。2人の患者は30代で死亡した。
.0005 セロイドリポフスチン症、神経細胞、10
CTSD, ARG399HIS
ソマリア人の両親から生まれた神経性セロイドリポフスチン症-10(CLN10;610127)の男児において、Hershesonら(2014)は、CTSD遺伝子のエクソン9にホモ接合性の変異を同定し、その結果、高度に保存された残基でarg399からhis(R399H)への置換が生じた。患者の線維芽細胞はカテプシンD活性の有意な低下(コントロール値の11%)を示した。患者は8歳の若年発症であった。