承認済シンボル:CRYL1
遺伝子名:crystallin lambda 1
参照:
HGNC: 18246
AllianceGenome : HGNC : 18246
NCBI:51084
Ensembl :ENSG00000165475
UCSC : uc001une.4
遺伝子OMIM番号609877
●遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
●遺伝子のグループ:MicroRNA protein coding host genes
●遺伝子座: 13q12.11
●ゲノム座標:(GRCh38): 13:20,403,669-20,525,857
遺伝子の別名
GDH
lambda-CRY
MGC149525
MGC149526
Alias names
crystallin, lamda 1
L-gulonate 3-dehydrogenase
lambda-crystallin homolog
遺伝子の概要
ウロン酸サイクルは、グルコースの代替代謝経路として機能し、グルコース異化の約5%を占めます。CRYL1遺伝子の産物は、ウロン酸サイクルにおいて、L-グロン酸をデヒドロ-L-グロン酸へと変換する脱水素反応を触媒します。この酵素活動にはNAD(H)が補酵素として必要であり、無機リン酸によってその活動が阻害される可能性があります。ウサギにおける同様の遺伝子の研究からは、このタンパク質が眼の水晶体で構造的な役割を果たしている可能性が示唆されています。
これらの特性から、CRYL1は代謝過程における重要な役割を担っていると考えられ、その機能や調節メカニズムの解明は、基礎生物学だけでなく、潜在的な治療標的としての可能性を探る上でも重要です。
遺伝子と関係のある疾患
Gene Cardsでは、CRYL1に関連する疾患には、五炭糖尿症、常染色体劣性難聴1Aなどがあることが記載されています。関連するパスウェイには、キシルロース-5-リン酸の形成、グリコサミノグリカン代謝があります。
Clinvarを見ると、likely pathogenic 2, pathogenic 50が登録されており、非症候性難聴1がその内容です。
遺伝子の発現とクローニング
ヒトCRYL1は319アミノ酸からなる酵素クリスタリンをコードしており、ウサギ、マウス、ラット、ウシ、ブタのラムダクリスタリンとそれぞれ83%、84%、85%、78%、75%の配列同一性を有しています。このタンパク質は、HCDHタンパク質に特徴的な2つのドメイン(C末端に1つ、N末端にNAD結合ドメイン)を持っています。
ヒト組織におけるノーザンブロット解析により、CRYL1の転写産物はユビキタスに発現していることが示され、特に肝臓と腎臓での発現レベルが最も高いことが確認されました。また、60の肝細胞癌サンプルを対象としたノーザンブロット分析と半定量的RT-PCRによって、CRYL1がサンプルの58%でダウンレギュレートされていることが示されました。これらの結果は、CRYL1が肝細胞癌の発症や進行に関与している可能性を示唆しており、この遺伝子のさらなる機能解析が重要であることを示しています。
遺伝子の構造
マッピング
シンテニーとは、異なる種のゲノム上で、遺伝子の順序が保存されている領域を指し、これにより、特定の遺伝子が関連する生物学的機能や疾患にどのように影響するかを理解するのに役立ちます。CRYL1遺伝子およびマウスのCryl1遺伝子のマッピングは、これらの遺伝子の機能解析や、関連する疾患の研究における重要な基盤となります。
CRYL1遺伝子は、クリスタリンζ型チロシンリアーゼ1をコードしており、この酵素はアミノ酸チロシンの分解に関与しています。遺伝子の位置の同定は、遺伝的疾患や代謝経路の異常におけるこの遺伝子の役割をさらに探求するための出発点となります。Chenらの研究は、ヒトとマウスのゲノムにおける遺伝子の配置と進化的関係に関する貴重な情報を提供しています。