承認済シンボル：CHST6
遺伝子名：carbohydrate sulfotransferase 6
参照：
HGNC:
AllianceGenome : HGNC :
NCBI：4166
Ensembl :ENSG00000183196
UCSC : uc002fef.4
遺伝子OMIM番号
●遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
●遺伝子のグループ：Sulfotransferases, membrane bound
●遺伝子座: 16q23.1
●ゲノム座標：(GRCh38): 16:75,472,042-75,495,441
遺伝子の別名
MCDC1
●Previous names
carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 6
遺伝子の概要
CHST6遺伝子の産物である酵素は、ケラタン硫酸の硫酸化パターンを制御します。ケラタン硫酸は、角膜の構造的整合性と機能を維持するために必要な糖タンパク質です。この硫酸化過程は、角膜の透明性に寄与し、光が眼球を通過して網膜に到達するのを助けます。
遺伝子の発現とクローニング
解析により、AI824100 cDNAから395アミノ酸からなるタンパク質が予測され、これはCHST6と命名されました。ヒト角膜におけるCHST6 mRNAの発現と硫酸化ケラタン硫酸の存在は、in situハイブリダイゼーションと免疫組織化学によって解析されました。この研究により、CHST6の発現がヒト角膜における硫酸化ケラタン硫酸の存在と相関していることが示され、MCDの病態にCHST6が関与している可能性が示唆されました。この発見は、MCDの分子生物学的基盤の理解を深め、将来的な治療法の開発に向けた重要な一歩となりました。
遺伝子の構造
研究者: Akama et al. (2000)
遺伝子: CHST6
エクソン数: 4
コーディング領域: エクソン3内にのみ含まれる
遺伝子の機能
分子遺伝学
El-Ashryら（2002）は、I型MCDを有する家系において、CHST6遺伝子に6つの新規ミスセンス変異を同定しました。これらの変異は角膜硫酸転移酵素の機能喪失によりMCDの表現型を説明します。
Aldaveら（2004）は、I型またはII型MCD患者において、CHST6遺伝子の10種類の変異を同定しました。これらの変異は対照群では観察されませんでした。特に、leu200からargへの変異（L200R）は複数の家系で見られ、変異のホットスポットであることが示唆されました。
Sultanaら（2005）は、インド南部のMCD患者において、26の異なるCHST6遺伝子の変異を同定しました。これらには14の新規変異が含まれていました。
Parkら（2015）は、韓国人MCD患者において複合ヘテロ接合体変異を同定しました。この中には新規変異も含まれており、最も頻度の高い変異（c.613C-T; R205W）は特定の家系で認められましたが、他の集団ではこれまで認められていないことが示されました。
これらの研究は、CHST6遺伝子の変異がMCDの原因であり、疾患の異なる形態間で変異のスペクトルが存在することを明らかにしています。さらに、CHST6遺伝子の変異と高密度リポ蛋白コレステロール（HDLC）との関連性についても調査が行われていますが、この関連性はまだ確認を待っています。
アレリックバリアント
.0001 斑状角膜ジストロフィー I型
CHST6, LYS174ARG
斑状角膜ジストロフィー(MCD; 217800)のI型患者において、Akamaら(2000)はCHST6遺伝子の1213A-G転移を同定し、lys174からarg(K174R)へのアミノ酸置換をもたらした。
.0002 斑状角膜ジストロフィーI型
CHST6, ASP203GLU
Akamaら(2000)は2家族において、I型黄斑角膜ジストロフィー(MCD; 217800)がCHST6遺伝子の1301C-A転座と関連し、蛋白質のasp203からgluへの(D203E)アミノ酸変化が予測されることを発見した。2家系のうち1家系は両親が血族であった。
.0003 斑状角膜ジストロフィーII型
chst6、5-プライム領域の置換
血縁関係のないII型黄斑角膜ジストロフィー(MCD; 217800)の2人の患者において、Akamaら(2000)はCHST6の上流領域にDNA再配列を発見し、CHST6エクソン1の上流に位置する2.5kbの領域が、元々CHST5(604817)エクソン1の上流に位置していた領域Aに置き換わっていることを明らかにした。CHST5遺伝子もMCD I型クリティカル領域の16q22に位置している。これら2人の患者はこの再配列のホモ接合体であった。
.0004 斑状角膜ジストロフィーII型
chst6、5プライム領域の欠失
赤間ら(2000)は、近親婚の3人の子供と4人目の血縁関係のない患者（いずれもII型黄斑角膜ジストロフィー(MCD; 217800)）において、CHST6遺伝子の5-プライム領域の欠失のホモ接合性を同定した。
.0005 斑状角膜ジストロフィーI型
斑状角膜ジストロフィーII型を含む
CHST6, LEU200ARG
I型黄斑角膜ジストロフィー(MCD; 217800)の3家族の罹患者において、Aldaveら(2004)は、CHST6遺伝子の1291T-Gトランスバージョン(leu200-to-arg(L200R)置換)、および別の変異：996T-Gトランスバージョン(cys102-to-gly変異(C102G; 605294.)の複合ヘテロ接合を同定した。 0006）、tyr110からcysへの変異（Y110C；605294.0007）をもたらす1021A-G転移、またはleu276からproへの変異（L276P；605294.0008）をもたらす1519T-C転移である。II型黄斑角膜ジストロフィーの2家族の罹患者において、Aldaveら（2004）は、L200R変異と、arg93からserへの変異（R93S; 605294.0009）を生じる969C-A転座、または未同定の変異の複合ヘテロ接合を同定した。CHST6遺伝子を挟むマイクロサテライトマーカーを用いたハプロタイプ解析では、L200R変異に共通の創始者効果は認められず、変異のホットスポットとしての位置づけが示唆された。
.0006 斑状角膜ジストロフィー I型
chst6, cys102gly
Aldaveら(2004)によるI型黄斑角膜ジストロフィー(MCD; 217800)の罹患家族において複合ヘテロ接合状態で発見されたCHST6遺伝子のcys102-to-gly(C102G)変異については、605294.0005を参照。
.0007 I型斑状角膜ジストロフィー
chst6, tyr110cys
Aldaveら(2004)によるI型黄斑角膜ジストロフィー(MCD; 217800)の罹患家族において複合ヘテロ接合状態で発見されたCHST6遺伝子のtyr110-to-cys(Y110C)変異については、605294.0005を参照。
.0008 I型斑状角膜ジストロフィー
chst6, leu276pro
Aldaveら(2004)によるI型黄斑角膜ジストロフィー(MCD; 217800)の罹患家族において複合ヘテロ接合状態で発見されたCHST6遺伝子のleu276-to-pro(L276P)変異については、605294.0005を参照。
.0009 II型斑状角膜ジストロフィー
chst6, arg93ser
Aldaveら(2004)によるII型黄斑角膜ジストロフィー(MCD; 217800)の罹患家族において複合ヘテロ接合状態で発見されたCHST6遺伝子のarg93-to-ser(R93S)変異については、605294.0005を参照。
プロフィール
この記事の筆者：仲田洋美（医師）
