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CDK4

承認済シンボル:CDK4
遺伝子名:cyclin dependent kinase 4
参照:
HGNC: 1773
AllianceGenome : HGNC : 1773
NCBI
Ensembl :ENSG00000135446
UCSC : uc001spv.4
遺伝子OMIM番号123829
●遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
●遺伝子のグループ:Cyclin dependent kinases
MicroRNA protein coding host genes
●遺伝子座: 12q14.1
●ゲノム座標:(GRCh38): 12:57,747,727-57,752,310

遺伝子の別名

PSK-J3

遺伝子の概要

サイクリン依存性キナーゼ-4(CDK4)は、細胞周期の調節に欠かせないプロテイン-セリンキナーゼの一つです。細胞分裂は細胞周期の特定のチェックポイント、特にG1からSフェーズへの移行やG2からMフェーズへの移行において厳密に制御されています。CDK4はこのプロセスにおいて中心的な役割を果たし、サイクリンDと結合することで活性化されます。この活性化により、細胞周期の進行に必要な基質のリン酸化が行われます。

CDK4の機能:
細胞周期の調節: CDK4は、特にG1フェーズからSフェーズへの移行を促進することで細胞周期の進行を調節します。これにより、DNAの複製が行われる準備が整います。
D型サイクリンとの相互作用: CDK4はD型サイクリン(D1, D2, D3)と複合体を形成し、これが細胞増殖の制御に関与します。
p16による阻害: CDK4の活性は、CDKN2A(p16)によって阻害されます。p16は細胞周期の進行を遅らせることで細胞の無秩序な増殖を防ぎ、がんの発生を抑制する役割を果たします。
臨床的意義:
CDK4はがんの研究において重要なターゲットです。CDK4の過剰活性化やp16の機能不全は、細胞の無秩序な増殖を引き起こし、がんの発生に寄与することが知られています。そのため、CDK4を標的としたがん治療戦略が開発されており、特定のがんタイプにおいてCDK4阻害剤の使用が検討されています。

研究と治療への応用:
CDK4とその調節メカニズムの理解は、新しいがん治療法の開発に向けた基礎研究に不可欠です。CDK4の活性を特異的に阻害する薬剤は、細胞周期を効果的に制御し、がん細胞の増殖を抑制する潜在的な治療法として期待されています。

遺伝子と関係のある疾患

{Melanoma, cutaneous malignant, 3} 悪性黒色腫3感受性 609048 AD  3

遺伝子の発現とクローニング

Hanksによる1987年の研究は、プロテイン-セリンキナーゼをコードする遺伝子の一つ、CDK4(サイクリン依存性キナーゼ4)のクローニングに成功した画期的な業績です。彼は、プロテイン-セリンキナーゼを認識するプローブを使用してHeLa細胞からのcDNAライブラリーをスクリーニングし、CDK4遺伝子を単離しました。この方法は、特定の遺伝子を効率的に同定するためのアプローチとして、分子生物学の分野において重要な進展を示しました。

Zuoらによる1996年の研究は、CDK4タンパク質の構造に関するさらなる詳細を明らかにしました。彼らは、CDK4タンパク質が303アミノ酸から構成されることを特定しました。この発見は、CDK4の生物学的機能やその活性化メカニズムを理解する上での基盤となり、細胞周期の調節におけるCDK4の役割についての洞察を深めました。

CDK4は、細胞周期のG1フェーズからSフェーズへの移行を調節する重要な酵素であり、その異常な活性化は多くのがん種の発生に関与しています。CDK4の構造と機能に関するこれらの研究は、がんの治療に向けた新たな治療標的の同定や、CDK4を標的とした抗がん剤の開発に貢献する可能性があります。これらの研究によって提供された知見は、細胞周期の調節メカニズムの理解を深め、がん生物学における重要な進展をもたらしました。

遺伝子の構造

Zuoらによる研究では、CDK4(サイクリン依存性キナーゼ4)遺伝子の構造が明らかにされました。この遺伝子は8個のエクソンから成り、全長が5キロベース(kb)に及ぶことが決定されました。CDK4は細胞周期の制御に重要な役割を果たすキナーゼであり、特にG1フェーズからSフェーズへの移行を促進することに関与しています。

CDK4の活性は、特定のサイクリン、特にサイクリンDとの結合によって調節されます。この結合により、CDK4はリン酸化され、活性化されます。活性化されたCDK4は、細胞周期の進行に必要な他のタンパク質のリン酸化を触媒し、細胞のDNA複製準備を促進します。

CDK4遺伝子の構造と機能の理解は、がんの研究において特に重要です。CDK4の異常な活性化は、細胞の無制限な増殖を引き起こし、多くのがん種の発生に寄与することが知られています。したがって、CDK4はがん治療における潜在的な標的の一つと見なされており、CDK4の機能を阻害することによって、がん細胞の増殖を抑制する新しい治療戦略が研究されています。

Zuoらによるこの遺伝子の構造解析は、CDK4の生物学的役割とその調節メカニズムのさらなる研究の基盤を提供し、がんを含むさまざまな疾患の理解と治療の進展に貢献しています。

マッピング

Demetrickらによる1994年の研究では、CDK4遺伝子が蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)を用いて染色体12q13にマッピングされました。この研究では、CDK2遺伝子も同じ染色体のバンドに位置していることが示されました。続くMitchell et al.の1995年の研究では、CDK4の位置をより詳細に分析し、12q14にマッピングしました。この位置はGLI遺伝子とCHOP遺伝子の遠位(つまりそれらより染色体の端に近い位置)にあり、12q13.3-q14.1に位置していると報告されました。また、MDM2遺伝子の近位(つまりMDM2より中心に近い位置)にあり、12q14.3-q15に位置すると結論付けられました。

これらのマッピング研究は、CDK4遺伝子の正確な染色体上の位置を明らかにし、CDK4が関与する可能性のある細胞周期制御やがん発生メカニズムの研究に重要な情報を提供します。染色体12q13-q15領域は、多くの重要な遺伝子が集中しており、この領域の遺伝子は細胞増殖、分化、および腫瘍形成に関与する多くの重要な生物学的プロセスに影響を及ぼす可能性があります。これらの研究によって提供される詳細な遺伝子マッピング情報は、特定の疾患の原因を理解し、将来的な治療法の開発に役立つ可能性があります。

遺伝子の機能

CDK4遺伝子の細胞周期の制御におけるその重要性と、さまざまな病態における役割を概説します。特に、このタンパク質はSer/Thrプロテインキナーゼファミリーに属し、酵母のcdc28やcdc2の遺伝子産物と高度に類似しています。これは、細胞周期のG1期の進行に不可欠なプロテインキナーゼ複合体の触媒サブユニットとして機能します。その活性はG1-S期に限定されており、D型サイクリンとCDK阻害剤p16(INK4a)によって細かく調節されています。

このキナーゼは、網膜芽細胞腫遺伝子産物(Rb)のリン酸化に関与し、これにより細胞周期のG1/S転移を促進します。このプロセスは、細胞がDNAを複製する準備をするために必要です。さらに、このキナーゼは有糸分裂細胞周期のG2/M転移、線維芽細胞の増殖を促進するなど、他の細胞周期過程にも関与しています。

CDKは、サイクリン依存性プロテインキナーゼホロ酵素複合体、細胞質、核内に存在し、クロマチンやサイクリン依存性プロテインキナーゼホロ酵素複合体の一部として機能します。このキナーゼの異常は、多発性の癌腫、家族性黒色腫、神経膠芽腫、肥満、2型糖尿病など、多くの疾患の発生に関連しています。また、子宮頸がん、腎臓がん、肺非小細胞がん、膵臓がん、移行細胞がんなど、さまざまな疾患のバイオマーカーとしての役割も持っています。

CDK4、D型サイクリン、p16(INK4a)、Rbを含む関連タンパク質の変異は、多くの癌の腫瘍形成に関連していることが発見されています。これらの知見は、CDKが細胞周期の制御において中心的な役割を果たし、その異常が広範な疾患の原因となる可能性があることを示しています。この理解は、がんや他の疾患の治療に向けた新たなアプローチの開発に寄与する可能性があります。

このテキストは、細胞周期の調節におけるサイクリン依存性キナーゼ(CDK)の役割とその病理学的影響に関する重要な研究結果をまとめたものです。ここで言及されている研究は、がん、免疫応答、および細胞増殖におけるCDKの重要性を示しています。

Harbourら(1999): RB1タンパク質のC末端領域のリン酸化が、細胞周期の進行を調節する分子内相互作用を開始させることを発見しました。CDK4/CDK6による初期のリン酸化がE2Fの転写抑制を解除し、その後のCDK2によるリン酸化がRBタンパク質のポケット構造の破壊を促進します。

Stepanovaら(1996): CDC37とHSP90がD型サイクリンに結合していないCDK4と結合し、CDK4の安定性を維持することを明らかにしました。これは、CDK4の機能と安定性が複合体形成に依存していることを示しています。

Modianoら(2000): 健常人の一部が、マイトジェンの非存在下でIL2に反応して増殖するT細胞においてCDK4のmRNA、タンパク質、活性を発現していることを発見しました。これは、CDK4がT細胞の増殖において重要な役割を果たす可能性があることを示唆しています。

Lazarovら(2002): がん原性RASがCDK4発現を減少させることでG1期の停止を誘導し、CDK4の共発現がRASによる増殖抑制を回避することを見いだしました。これは、CDK4ががんの進行において重要な役割を果たすことを示しています。

Matsuuraら(2004): SMAD3がCDK4とCDK2の主要な生理的基質であること、およびそのリン酸化がSmad3の機能に影響を与えることを明らかにしました。これは、細胞周期の進行と転写活性の調節におけるCDKの役割を示しています。

Leeら(2014): インスリンがCcnd1/Cdk4を介して肝グルコース産生を抑制するメカニズムを発見しました。これは、細胞周期機構が細胞分裂以外の生理的プロセスにも関与することを示しています。

Zhangら(2018): CDK4/6阻害がPDL1タンパク質の安定性を高めることにより、免疫チェックポイント阻害剤との併用療法の可能性を示しました。これは、がん治療における新たな戦略を提供します。

これらの研究は、CDKが細胞周期調節、免疫応答、がんの進行において中心的な役割を果たすことを示し、これらの経路を標的とする治療戦略の開発につながっています。

分子遺伝学

分子遺伝学においてヒト皮膚悪性黒色腫(Cutaneous Malignant Melanoma, CMM3; OMIM番号609048)の研究は、特定の遺伝子変異の同定を通じてがんの発生機序を理解することを目指しています。この文脈で、いくつかの重要な発見がありました。

Wolfelらによる1995年の研究では、CDK4遺伝子の変異(R24C;123829.0001)がヒト皮膚悪性黒色腫細胞株で同定され、分析した28の黒色腫のうちさらに1つのサンプルで同じ変異が認められました。

Zuoらは1996年に、悪性黒色腫を有する血縁関係のない2家系の罹患者において、生殖細胞系列のR24C変異を同定しました。

1998年、Soufirらはフランスの悪性黒色腫家系でR24H(123829.0002)変異を同定しました。

さらに、Molvenらは2005年に、1969年にGrimstvedtによって最初に報告されたノルウェーの大規模な血統でR24H変異を同定しました。彼らの研究では、メラノーマに罹患しやすい家系の約20%がCDKN2A遺伝子座(600160)に変異を持つのに対し、CDK4遺伝子座に変異を持つ家系は非常に稀で、世界でわずか6家系のみがこの疾患と関連していることが示されました。

これらの研究結果は、特定の遺伝子変異が悪性黒色腫の発生にどのように関与しているかを理解する上で非常に重要です。CDK4遺伝子は細胞周期の調節に関与しており、その変異は細胞の無秩序な増殖を促進し、がんの形成に寄与する可能性があります。これらの発見は、遺伝性がんのリスク評価や将来的な治療法の開発に役立つ可能性があります。

動物モデル

この説明は、特定の遺伝子欠損マウスモデルを使用して細胞周期制御と疾患発生におけるD型サイクリン依存性キナーゼ(CDK4およびCDK6)の役割に関する研究を要約しています。

CDK4欠損マウスの主な所見(Zouら、2002年)
生存可能性:CDK4を欠損しているマウスは生きて成長することが可能であるが、特定の健康問題が観察される。
健康問題:これには膵β細胞の変性による糖尿病、下垂体の低形成と機能障害による成長遅延と不妊が含まれる。
細胞増殖の遅れ:胚線維芽細胞は初めは正常に増殖するが、休止期後の細胞周期再突入に遅れが見られる。
老化のメカニズム:CDK4はRasを介した形質転換に必要であり、その破壊はArfやp53に依存しない老化を引き起こす。老化はCDKN1Aの安定性の増加と関連している。
CDK6欠損マウスの主な所見(Malumbresら、2004年)
生存可能性と発育:CDK6欠損マウスも生存可能であり、造血にはわずかな障害があるものの、正常に発育する。
CDK4とCDK6の二重欠損胚:重度の貧血により胚発生の後期に死亡するが、正常な器官形成を示し、ほとんどの細胞型が正常に増殖する。
細胞増殖の観察:in vitroで、CDK4とCDK6を欠損した胚線維芽細胞は増殖し、不死化する。休止期のCDK4/CDK6欠損細胞は血清刺激に応答してS期に入るが、効率は低下する。
サイクリン依存性キナーゼの役割:D型サイクリン依存性キナーゼが細胞周期の開始に必須ではないことを示し、細胞増殖を開始するための別のメカニズムの存在を示唆する。

これらの研究は、細胞周期制御と疾患発生におけるCDK4およびCDK6の重要な役割を示していますが、これらのキナーゼがすべての細胞タイプや条件で絶対に必要とされるわけではないことも示唆しています。代わりに、細胞はこれらのキナーゼの欠如を補うための代替経路を持つことが示されています。

アレリックバリアント

アレリックバリアント(2例):ClinVar はこちら

0001 皮膚悪性黒色腫、感受性、3
CDK4, ARG24CYS
皮膚悪性黒色腫-3(CMM3;609048)細胞株において、Wolfelら(1995)はCDK4遺伝子のarg24-to-cys(R24C)変異を同定した。変異CDK4対立遺伝子は自己培養黒色腫細胞と転移組織に存在したが、患者のリンパ球には存在しなかったことから、体細胞変異であることが示された。R24C変異は細胞溶解性Tリンパ球によって認識されるCDK4ペプチドの一部であり、CDK4阻害剤p16(INK4A)(600160)の結合を阻害したが、p21(300237)やp27(KIP1; 600778)の結合は阻害しなかった。この結果は、CDK4の突然変異が、癌抑制因子p16が発揮する細胞周期制御を破壊し、その結果、メラノーマに対する遺伝的素因をもたらすことを示唆した。UV病変に典型的な同じ変異が、解析した28の黒色腫のうち、さらに1つの黒色腫で見つかった。変異したCDK4タンパク質は、ヒト黒色腫組織においてHLA-A 2.1制限自己細胞溶解性Tリンパ球によって認識される腫瘍特異的抗原として同定されていた。Wolfelら(1995)は、この患者のR24C変異によって規定された腫瘍特異的抗原が、腫瘍拒絶反応の標的となったことを示唆した。

Zuoら(1996)は、悪性黒色腫の2家系でR24C突然変異を生殖細胞系列突然変異として同定した。この変異は悪性黒色腫患者11人中11人、非罹患者17人中2人、配偶者5人中1人にも検出されなかった。R24C変異はCDK4のp16(INK4A)結合ドメインに特異的な影響を及ぼすが、CDK4がサイクリンDと結合して機能的キナーゼを形成する能力には影響を及ぼさない。Zuoら(1996)は、生殖細胞系列のR24C突然変異は、p16(INK4A)による正常な生理的阻害に抵抗性の優性癌遺伝子を生成すると結論づけた。彼らは、ヒトの生殖細胞系列で伝達される優性癌遺伝子の唯一の例は、MEN2A(171400)、MEN2B(162300)、および甲状腺髄様癌(171400)を生じるRET(164761)遺伝子であると指摘した。

.0002 皮膚悪性黒色腫、感受性、3
CDK4, ARG24HIS
Soufirら(1998年)は、皮膚悪性黒色腫(CMM3;609048)を有するフランス人48家系中1家系(2%)において、CDK4遺伝子のarg24-to-his(R24H)生殖細胞系列変異を同定した。

Grimstvedt(1969)によって最初に報告された多発性異型母斑と悪性黒色腫を有するノルウェーの大血統において、Molvenら(2005)はR24H突然変異を同定した。6世代、100人以上の家族の追跡が行われ、20例の黒色腫が確認された。家族の1人が眼黒色腫であったが、この被験者の保存組織サンプルからはCDK4突然変異は検出されなかった。著者らは、この家族の眼黒色腫は散発性であり、皮膚腫瘍とは異なる病因が示唆されると結論づけた。Molvenら(2005年)は、R24H変異を有するオーストラリア人とイギリス人の黒色腫家族に関する未発表のデータを引用している。ノルウェーの家系におけるCDK4突然変異は、フランス、オーストラリア、およびイギリスのメラノーマ家系におけるものと同一であったが、CDK4遺伝子を挟むマイクロサテライトマーカーおよび遺伝子内のSNPを用いたハプロタイプ解析では、共通の創始者の可能性は支持されず、むしろ少なくとも2つの独立した突然変異事象が示唆された。Molvenら(2005年)は、現在までに報告されているCDK4黒色腫家系はすべてアミノ酸24の置換があり、これは選択圧の結果である可能性があると指摘している。彼らは、コドン24のCGジヌクレオチドがCDK4遺伝子の突然変異のホットスポットである可能性を示唆した。

参考文献

仲田洋美 医師(臨床遺伝専門医)

この記事の監修・執筆者:仲田 洋美

(臨床遺伝専門医/がん薬物療法専門医/総合内科専門医)

ミネルバクリニック院長。1995年に医師免許を取得後、 臨床遺伝学・内科学・腫瘍学を軸に診療を続けてきました。 のべ10万人以上のご家族の意思決定と向き合ってきた臨床遺伝専門医です。

出生前診断(NIPT・確定検査・遺伝カウンセリング)においては、 検査結果の数値そのものだけでなく、 「結果をどう受け止め、どう生きるか」までを医療の責任と捉え、 一貫した遺伝カウンセリングと医学的支援を行っています。

ハイティーンの時期にベルギーで過ごし、 日本人として異文化の中で生活した経験があります。 価値観や宗教観、医療への向き合い方が国や文化によって異なることを体感しました。 この経験は現在の診療においても、 「医学的に正しいこと」と「その人にとって受け止められること」の両立を考える姿勢の基盤となっています。

また、初めての妊娠・出産で一卵性双生児を妊娠し、 36週6日で一人を死産した経験があります。 その出来事は、妊娠・出産が女性の心身に与える影響の大きさ、 そして「トラウマ」となり得る体験の重みを深く考える契機となりました。 現在は、女性を妊娠・出産のトラウマから守る医療を使命の一つとし、 出生前診断や遺伝カウンセリングに取り組んでいます。

出生前診断は単なる検査ではなく、 家族の未来に関わる重要な意思決定です。 年齢や統計だけで判断するのではなく、 医学的根拠と心理的支援の両面から、 ご家族が後悔の少ない選択をできるよう伴走することを大切にしています。

日本人類遺伝学会認定 臨床遺伝専門医/日本内科学会認定 総合内科専門医/ 日本臨床腫瘍学会認定 がん薬物療法専門医。 2025年には APAC地域における出生前検査分野のリーダーとして国際的評価を受け、 複数の海外メディア・専門誌で特集掲載されました。

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