承認済シンボル:ATP10A
遺伝子名:ATPase phospholipid transporting 10A (putative)
参照:
HGNC: 13542
AllianceGenome : HGNC : 13542
NCBI:57194
遺伝子OMIM番号605855
Ensembl :ENSG00000206190
UCSC : uc010ayu.4
遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
遺伝子のグループ:ATPase phospholipid transporting
MicroRNA protein coding host genes
遺伝子座: 15q12
遺伝子の別名
ATPVA
ATPVC
KIAA0566
概要
ATPaseは、ATP(アデノシン三リン酸)を利用して細胞膜を越えて特定の分子を輸送する役割を果たすタンパク質です。ATP10Aは、リン脂質(リン脂質)と呼ばれる細胞膜成分の輸送に関与しており、特に細胞膜の脂質バイレイヤー(二重膜)における脂質の輸送に関連しています。
ATP10A遺伝子に関する詳細な情報やその生物学的機能は研究が進行中であり、特に細胞膜の脂質輸送に関連するさまざまなプロセスに影響を与える可能性があります。また、遺伝的変異や多型がATP10A遺伝子に関連していることも研究されています。
遺伝子と関係のある疾患
ATP10C遺伝子の病的変異は、ClinVarに自閉症スペクトラム障害との関連を記載されています
ATP10C遺伝子と自閉症との間には、肯定的な遺伝的関連性を示す研究と否定的な遺伝的関連性を示す研究があり、相反する結果となっていたが、現在では上記のようにClinVarにPathogenicで登録されています。
遺伝子の発現とクローニング
この研究では、さらにRT-PCR(リバーストランスクリプトポリメラーゼ連鎖反応)解析を行い、ATP10C遺伝子の発現パターンを調査しました。その結果、この遺伝子は広範囲にわたって発現していることがわかり、特に腎臓での発現量が最も高いことが示されました。また、肺、脳、前立腺、精巣、卵巣、小腸でも発現が確認されました。
このような研究は、特定の遺伝子の機能やそれが関与する生物学的プロセスを理解する上で重要な一歩となります。ATP10Cのような遺伝子の発現と機能の詳細な分析は、将来的には新しい治療標的の同定や疾患のメカニズム解明に貢献する可能性があります。
マッピング
続いて、1999年にHalleckらはゲノム配列解析を行い、ATP10C遺伝子(彼らはこれをATPVCと呼んでいる)を具体的にヒトの15q11-q13染色体領域にマッピングしました。これにより、ATP10C遺伝子の位置がより詳細に特定されました。
また、マウスにおいては、ATP10a遺伝子が7番染色体にマッピングされていることが、Kayashima et al.の研究によって明らかにされました。これは、種間での遺伝子の位置の類似性や違いを理解する上で有用な情報です。
これらのマッピング研究は、遺伝子の機能解析や遺伝性疾患の原因究明に重要な役割を果たします。特に、ATP10Cのような遺伝子の正確な位置を知ることは、その遺伝子が関与する可能性のある生理的プロセスや病態の解明に寄与します。
遺伝子の機能
アンジェルマン症候群(AS)の関連:
ASは運動失調、てんかん、神経行動異常を伴う疾患です。
多くの症例は染色体15q11-q13のde novo母体欠失に起因します。
Meguroらは、AS原因として最も一般的な欠失区間にATP10C(ATP10Aの類似遺伝子)がマップされ、AS患者ではその発現が低下していることを報告しました。
ATP10Cの機能とインプリンティング:
ATP10Cはリン脂質輸送に関与する可能性が示唆されています。
Herzingらは、ATP10CがUBE3Aの近くに位置し、母体発現されることを示しました。
Kashiwagiらは、ATP10Cが海馬と嗅球で母性発現を示し、中枢神経系の特定領域でのインプリンティングが神経疾患と関連する可能性を示唆しました。
マウスにおけるATP10A遺伝子の研究:
Kayashimaらは、マウスのAtp10a遺伝子はインプリンティングを受けていないと結論付けました。
この遺伝子は多くの組織で発現し、脳や白色脂肪組織で特に高い発現を示しました。
ATP10Aの発現パターン:
Hogartらによる研究では、正常対照脳サンプルの一部でATP10Aの単遺伝子発現が見られ、PWS(プラダー・ウィリー症候群)脳ではATP10Aの発現が減少していました。
彼らは、ATP10Aの発現は性別や遺伝的変異の影響を受ける可能性があると指摘しました。
これらの研究は、ATP10A及び関連する遺伝子の複雑な役割と、神経疾患、特にASやPWSにおけるその関与を示しています。この分野は進行中の研究が多く、今後の発見によってさらに明らかになることが期待されます。