ジンクフィンガー(Zinc finger)はDNA結合タンパク質にしばしば見られる小さな構造モチーフである。C2H2型ジンクフィンガーは、特徴的なアミノ酸配列と構造を持つジンクフィンガータンパク質の特定のクラスである。C2H2という名前は、亜鉛イオンを配位し、構造を安定化させる2つのシステイン(C)と2つのヒスチジン(H)残基の存在を意味する。

C2H2型ジンクフィンガーの主な特徴
- 構造
- 各C2H2型ジンクフィンガーは通常約30個のアミノ酸からなり、コンパクトな球状構造を形成している。亜鉛イオンは2つのシステインと2つのヒスチジンによって配位され、タンパク質を安定化させるジンクフィンガー構造を形成する。
- DNA結合
- C2H2型ジンクフィンガーはDNA結合能力で知られている。ジンクフィンガー領域内の特異的なアミノ酸配列により、DNAと配列特異的に相互作用することができる。通常、各ジンクフィンガーはDNA上の3つのヌクレオチドを認識して結合する。
- モジュール性
- C2H2型ジンクフィンガーを含む多くのタンパク質は、複数のジンクフィンガーがタンデムに配列している。配列中の各亜鉛フィンガーは特定のDNA配列との結合に寄与し、タンパク質がより長くより特異的なDNA配列を認識することを可能にする。
- 転写因子
- C2H2型ジンクフィンガータンパク質はしばしば転写因子として機能し、特定のDNA配列に結合することで遺伝子の発現を制御し、転写に関与する他のタンパク質のリクルートに影響を与える。
- 多様な機能
- C2H2型ジンクフィンガーを含むタンパク質は、発生、細胞分化、免疫応答を含む広範な生物学的プロセスに関与している。遺伝子発現の制御や様々な細胞内経路の調節において重要な役割を果たしている。
- Krüppel-associated box (KRAB)ドメイン
- C2H2型ジンクフィンガータンパク質の中には、転写抑制に関与するKRABドメインを持つものがある。KRABドメインはコ・リプレッサー・タンパク質と相互作用して遺伝子発現を抑制する。
C2H2型ジンクフィンガーのモジュール性と配列特異性により、カスタマイズされたDNA結合特異性を持つタンパク質を設計するための汎用性の高いコンポーネントとなっている。このことが、分子生物学研究における標的ゲノム編集や遺伝子制御のための、人工ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)や転写活性化因子様エフェクター(TALE)の開発につながっている。さらに、ゲノム編集に広く使われているCRISPR/Cas9システムも、DNA結合にジンクフィンガーを利用している。
Zinc fingers C2H2-typeに属する758遺伝子
ADNP
AEBP2
BNC1
BNC2
CTCF
CTCFL
DNAJC21
DZIP1
DZIP1L
EGR1
EGR2
EGR3
EGR4
E4F1
GFI1B
GLIS1
GLIS2
GLI1
GLI2
GLI3
GTF3A
IKZF1
IKZF2
IKZF3
IKZF4
IKZF5
INSM2
KLF1
KLF2
KLF3
KLF4
KLF5
KLF6
KLF7
KLF9
KLF10
KLF11
KLF12
KLF13
KLF14
KLF15
KLF16
MECOM
OSR1
OSR2
OVOL1
OVOL3
PLAGL1
POGZ
PRDM1
PRDM2
PRDM4
PRDM5
PRDM6
PRDM8
PRDM10
PRDM12
PRDM13
PRDM14
PRDM16
RLF
RREB1
SNAI1
SNAI2
SP1
SP2
SP3
SP4
SP5
SP6
SP7
SP8
SUZ12
TRPS1
TSHZ1
WT1
YY1
ZBTB3
ZBTB5
ZBTB10
ZBTB12
ZEB1
ZEB2
ZFHX4
ZFP28
ZFTA
ZHX1
ZHX2
ZHX3
ZIC2
ZIC4
ZIC5
ZNF2
ZNF3
ZNF7
ZNF8
ZNF10
ZNF12
ZNF14
ZNF16
ZNF17
ZNF18
ZNF19
ZNF20
ZNF22
ZNF23
ZNF24
ZNF25
ZNF26
ZNF28
ZNF30
ZNF32
ZNF33A
ZNF33B
ZNF34
ZNF35
ZKSCAN1
ZNF37A
ZNF37BP
ZNF37CP
ZSCAN21
HIVEP1
HIVEP2
HIVEP3
ZNF41
MZF1
ZNF43
ZNF44
ZNF45
ZBTB25
ZNF48
ZSCAN22
BCL6
ZNF56P
ZNF57
ZBTB17
BCL6B
ZNF66
ZNF69
ZNF70
ZNF71
ZNF73P
ZNF74
ZNF75A
ZNF75BP
ZNF75CP
ZNF75D
ZNF76
ZNF77
ZNF79
ZNF80
ZNF81
ZNF83
ZNF84
ZNF85
ZFPM1
ZFPM2
ZNF90
ZNF91
ZNF92
ZNF93
ZSCAN12
ZNF98
ZNF99
ZNF100
ZNF101
ZNF106
ZNF107
ZNF112
ZNF114
ZNF117
ZNF121
ZNF124
ZNF131
ZNF132
ZNF133
ZNF134
ZNF135
ZNF136
ZNF138
ZNF140
ZNF141
ZNF142
ZNF143
ZBTB16
ZNF146
ZNF148
ZNF154
ZNF155
ZNF157
ZNF160
VEZF1
GFI1
ZNF165
ZKSCAN7
ZNF169
ZNF174
ZNF175
ZNF177
ZNF180
ZNF181
ZNF182
ZNF184
ZSCAN26
ZNF189
ZKSCAN8
ZSCAN9
ZNF195
ZNF197
ZNF200
ZIC1
ZNF202
ZIC3
ZNF205
ZSCAN10
ZNF207
ZNF208
ZNF211
ZNF212
ZNF213
ZNF214
ZNF215
ZNF217
TSHZ2
ZNF219
ZNF221
ZNF222
ZNF223
ZNF224
ZNF225
ZNF226
ZNF227
ZNF229
ZNF230
ZNF232
ZNF233
ZNF234
ZNF235
ZNF236
ZBTB18
ZNF239
ZNF248
ZNF250
ZNF251
ZNF253
ZNF254
ZNF256
ZNF257
ZNF260
ZNF263
ZNF264
ZNF266
ZNF267
ZNF268
ZNF271P
ZNF273
ZNF274
ZNF275
ZNF276
ZNF277
PATZ1
ZNF280A
ZNF280B
ZNF280C
ZNF280D
ZNF281
ZNF282
ZNF283
ZNF284
ZNF285
ZNF285BP
ZNF285CP
ZNF285DP
ZNF286A
ZNF286B
ZNF287
ZBTB20
SCAPER
ZNF292
SNAI3
ZBTB21
ZNF296
ZBTB22
ZBTB43
PRDM15
ZNF300
ZNF302
ZNF304
ZKSCAN3
ZKSCAN4
ZNF311
FEZF2
FEZF1
ZNF316
ZNF317
ZNF318
ZNF319
ZNF320
ZNF322
ZSCAN31
ZNF324
ZNF324B
ZNF326
ZNF329
ZNF331
ZNF333
ZNF334
ZNF335
GZF1
ZNF337
ZFP64
OVOL2
ZBTB46
ZNF341
ZNF343
ZNF345
ZNF347
ZBTB33
ZNF350
ZNF354A
ZNF354B
ZNF354C
ZNF358
ZSCAN20
ZNF362
ZNF365
ZNF366
ZNF367
ZNF382
ZNF383
ZNF384
ZSCAN23
ZNF391
ZSCAN16
KLF17
ZNF394
ZNF395
ZNF396
ZNF397
ZNF398
ZNF404
ZFAT
ZNF407
ZNF408
ZFHX2
ZNF410
ZNF414
ZNF415
ZNF416
ZNF417
ZNF418
ZNF419
ZNF420
ZNF423
ZNF425
ZNF426
ZNF428
ZNF429
ZNF430
ZNF431
ZNF432
ZNF433
ZSCAN32
ZNF436
ZBTB2
ZNF438
ZNF439
ZNF440
ZNF441
ZNF442
ZNF443
ZNF444
ZNF445
ZNF446
ZSCAN18
ZNF449
ZBTB24
ZNF451
ZNF454
ZNF460
ZNF461
ZNF462
REPIN1
ZNF467
ZNF468
ZNF469
ZNF470
ZNF471
ZNF473
ZNF474
ZFP1
ZBTB14
ZNF479
ZNF480
ZBTB26
ZBTB6
ZNF483
ZNF484
ZNF485
ZNF486
ZNF487
ZNF488
ZNF490
ZNF491
ZNF492
ZNF493
ZSCAN4
ZSCAN5A
ZSCAN5B
ZSCAN5C
ZSCAN5DP
ZNF496
ZNF497
ZSCAN25
ZBTB45
ZNF500
ZNF501
ZNF502
ZNF503
ZNF506
ZNF507
ADNP2
ZBTB49
ZNF510
ZNF511
ZNF512
ZNF512B
ZNF513
ZNF514
GLIS3
ZNF516
ZNF517
ZNF518A
ZNF518B
ZNF519
ZNF521
ZNF524
ZNF525
ZNF526
ZNF527
ZNF528
ZNF529
ZNF530
ZFP14
ZNF532
ZNF534
ZNF536
TSHZ3
ZBTB32
ZNF540
ZNF541
ZNF542P
ZNF543
ZNF544
ZFP82
ZNF546
ZNF547
ZNF548
ZNF549
ZNF550
ZNF551
ZNF552
ZNF554
ZNF555
ZNF556
ZNF557
ZNF558
ZNF559
ZNF560
ZNF561
ZNF562
ZNF563
ZNF564
ZNF565
ZNF566
ZNF567
ZNF568
ZNF569
ZNF570
ZNF571
ZNF572
ZNF573
ZNF574
ZNF575
ZNF576
ZNF577
ZNF578
ZNF579
ZNF580
ZNF581
ZNF582
ZNF583
ZNF584
ZNF585A
ZNF585B
ZNF586
ZNF587
ZNF587B
ZNF589
ZNF592
ZNF593
ZNF594
ZNF595
ZNF596
ZNF597
ZNF598
ZNF599
ZNF600
ZNF605
ZNF606
ZNF607
ZNF608
ZNF609
ZNF610
ZNF611
ZNF613
ZNF614
ZNF615
ZNF616
ZNF618
ZNF619
ZNF620
ZNF621
ZNF623
ZNF624
ZNF625
ZNF626
ZNF627
ZNF628
ZNF629
ZNF630
YY2
ZNF639
ZNF641
ZFP69
ZFP69B
ZNF644
ZNF646
ZNF648
ZNF649
ZBTB47
ZNF652
ZNF653
ZNF654
ZNF655
ZIM2
ZIM3
ZNF658
ZNF660
ZNF662
ZNF663P
ZNF664
ZNF665
ZNF667
ZNF668
ZNF669
ZNF670
ZNF671
ZNF672
ZNF674
ZNF675
ZNF676
ZNF677
ZNF678
ZNF679
ZNF680
ZNF681
ZNF682
ZNF683
ZNF684
ZNF687
ZNF688
ZNF689
ZSCAN29
ZNF691
ZNF692
CASZ1
ZKSCAN2
ZNF695
ZNF696
ZNF697
ZFP57
ZNF699
ZNF700
ZNF701
ZNF703
ZNF704
ZNF705A
ZNF705B
ZNF705CP
ZNF705D
ZNF705EP
ZNF705G
ZNF706
ZNF707
ZNF708
ZNF709
ZNF710
ZNF711
ZNF713
ZNF714
ZNF716
ZNF717
ZNF718
ZNF721
ZNF722
ZNF723
ZNF724
ZNF726
ZNF727
ZNF728
ZNF729
ZNF730
ZNF732
ZNF735
ZNF736
ZNF737
ZNF740
KLF8
HINFP
ANKZF1
ZFP30
ZNF746
ZNF747
ZNF749
ZFP2
ZFP3
ZFP41
ZFP42
ZFP62
ZFP90
ZFP91
ZNF761
ZIK1
ZNF763
ZNF764
ZNF765
ZNF766
ZNF767P
ZNF768
RBAK
ZNF770
ZNF771
ZNF772
ZNF773
ZNF774
ZNF775
ZNF776
ZNF777
ZNF778
ZNF780A
ZNF780B
ZNF781
ZNF782
ZNF783
ZNF784
ZNF785
ZNF786
ZNF787
ZNF788P
ZNF789
ZNF790
ZNF791
ZNF792
ZNF793
SALL1
SALL2
SALL3
SALL4
FIZ1
ZNF799
ZNF800
MAZ
JAZF1
WIZ
ZNF804A
ZNF804B
ZNF805
ZNF807P
ZNF808
ZNF812P
ZNF813
ZNF814
ZNF816
ZNF821
ATMIN
ZNF823
ZNF827
CHAMP1
ZNF829
ZNF831
ZNF835
ZNF836
ZNF837
ZNF839
ZNF841
ZNF843
ZNF844
ZNF845
ZNF846
ZNF850
ZBTB44
ZNF852
ZNF853
ZSCAN2
ZBTB48
BCL11A
BCL11B
ZBTB7A
ZBTB7B
ZBTB7C
ZNF860
ZNF865
ZNF875
ZNF878
ZNF879
ZNF880
ZNF883
ZNF888
ZNF891
ZNF892
ZXDA
ZFP92
SCRT1
SCRT2
PRDM9
PLAGL2
HIC1
MYNN
ZBTB4
PEG3
ZXDB
ZFP37
HIC2
ZBTB37
ZBTB1
PRDM7
ZFY
PLAG1
ZBTB11
ZKSCAN5
ZSCAN1
ZBTB8A
ZBTB8B
ZSCAN30
ZBTB34
ZBTB9
ZBTB38
ZBTB39
ZBTB40
ZBTB41
ZBTB42
ZFX
ZFHX3
GLI4
SP9
ZUP1
ZXDC
この記事の著者:仲田洋美医師
医籍登録番号 第371210号
日本内科学会 総合内科専門医 第7900号
日本臨床腫瘍学会 がん薬物療法専門医 第1000001号
臨床遺伝専門医制度委員会認定 臨床遺伝専門医 第755号



