トランスクリプトーム transcriptome
トランスクリプトームとは、個体または細胞集団における、コーディングおよびノンコーディングを含むすべてのRNA転写産物の集合のことをさしています。すべてのRNAを指すこともあれば、mRNAのみを指すこともある。トランスクリプトームとは、transcript(転写)とgenome(ゲノム)を組み合わせた造語です。
トランスクリプトームのアノテーションの初期段階では、1980年代に公開されたcDNAライブラリーから始まりました。その後、ハイスループット技術の登場により、トランスクリプトームに関するデータをより早く、より効率的に取得できるようになりました。トランスクリプトームの研究には,ハイブリダイゼーションベースの手法であるDNAマイクロアレイとシークエンスベースの手法であるRNA-seqという2つの生物学的手法が用いられています。
RNA-seqのほうがより好ましい手法であり、2010年代以降のトランスクリプトーム研究の主流となっています。
シングルセル・トランスクリプトームは、文字通り一つの細胞のトランスクリプトームを分析する、つまり、個々の細胞内での経時的な転写産物の変化を追跡することができます。
トランスクリプトームから得られたデータは、細胞分化、発がん、転写制御、バイオマーカー探索などのプロセスに関する知見を得るための研究や、進化の過程における系統関係の確立や、体外受精にも応用されています。
この記事の著者:仲田洋美医師
医籍登録番号 第371210号
日本内科学会 総合内科専門医 第7900号
日本臨床腫瘍学会 がん薬物療法専門医 第1000001号
臨床遺伝専門医制度委員会認定 臨床遺伝専門医 第755号