目次
ポリコーム群タンパク(PcG)は、遺伝子発現の抑制に重要な役割を果たす複合体PRC1とPRC2を含みます。本記事では、これらの複合体の基本構造と機能、エピジェネティクスにおける役割、関連疾患、そして最新の研究動向について詳しく解説します。
ポリコーム群タンパク(PcG)とは
PcGの基本構造と機能
ポリコーム群タンパク(PcG)は、遺伝子発現の抑制に重要なエピジェネティック調節因子です。PcGは主に二つの主要な複合体、PRC1(Polycomb Repressive Complex 1)とPRC2(Polycomb Repressive Complex 2)を形成し、それぞれが異なるメカニズムで遺伝子のサイレンシングを行います。
– PRC1は、ヒストンH2Aのユビキチン化を介してクロマチンを凝縮し、遺伝子の転写を抑制します。
– PRC2は、ヒストンH3のリジン27(H3K27)をメチル化することで、クロマチンをコンパクトにし、遺伝子の転写を抑制します。
これにより、PcGは細胞の発生過程や分化、恒常性維持に重要な役割を果たしています。
PcGの歴史と発見
ポリコーム群タンパク(Polycomb Group Proteins, PcG)の研究は、20世紀初頭にまで遡ります。最初に発見されたのは、ショウジョウバエ(Drosophila melanogaster)の胚発生において、特定の遺伝子の発現を抑制する役割を持つ遺伝子群でした。これらの遺伝子は、形態形成や発生過程において重要な機能を果たしており、その後、同様の機能を持つPcGタンパク質が哺乳類を含む多くの生物種で発見されました。この発見により、PcGタンパク質が進化的に保存された遺伝子サイレンシングの重要なメカニズムであることが明らかになりました。
● PcGタンパク質の発見と初期研究
PcGタンパク質は、最初にショウジョウバエの胚発生において発見されました。これらのタンパク質は、Hox遺伝子の発現を抑制することで、体節のアイデンティティを維持する役割を果たします[10][13]。この発見は、PcGタンパク質が遺伝子発現の長期的な制御に関与していることを示唆しました。
● PcGタンパク質の機能とメカニズム
PcGタンパク質は、主に二つの主要な複合体、すなわちポリコーム抑制複合体1(PRC1)とポリコーム抑制複合体2(PRC2)を形成します。PRC1はヒストンH2Aのモノユビキチン化を行い、PRC2はヒストンH3のリジン27のトリメチル化を行います[1][2][4][6]。これらの修飾は、クロマチンの構造を変化させ、遺伝子の発現を抑制します。
● 進化的保存と多様性
PcGタンパク質は、動物や植物を含む多くの生物種で進化的に保存されています。これらのタンパク質は、発生過程や細胞分化、ストレス応答など、さまざまな生物学的プロセスにおいて重要な役割を果たします[4][5][7]。特に、哺乳類においては、PcGタンパク質は幹細胞のアイデンティティ維持やX染色体の不活性化などに関与しています[10][11]。
● PcGタンパク質の研究の重要性
PcGタンパク質の研究は、遺伝子発現のエピジェネティックな制御メカニズムを理解する上で重要です。これらのタンパク質は、発生過程や病気の進行において重要な役割を果たしており、特にがん研究においては、PcGタンパク質の異常が腫瘍形成や進行に寄与することが示されています[8][11][15]。
以上のように、PcGタンパク質は遺伝子サイレンシングの重要なメカニズムであり、その研究は発生生物学や病理学において重要な知見を提供しています。
- 参考文献・出典
-
[1] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3662373/
[2] www.frontiersin.org/journals/plant-science/articles/10.3389/fpls.2013.00454/full
[3] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19738629/
[4] bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-019-5905-9
[5] www.nature.com/articles/s42003-023-05501-x
[6] www.nature.com/articles/nsmb.2669
[7] www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2024.1383200/full
[8] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4718713/
[9] cshperspectives.cshlp.org/content/6/11/a019331.full
[10] en.wikipedia.org/wiki/Polycomb-group_proteins
[11] www.nature.com/articles/s41422-021-00606-6
[12] epigenie.com/key-epigenetic-players/chromatin-modifying-and-dna-binding-proteins/polycomb-group-proteins/
[13] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC110650/
[14] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4413232/
[15] academic.oup.com/narcancer/article/3/4/zcab039/6381044
[16] www.mpipz.mpg.de/turck/project_1
[17] academic.oup.com/nar/article/50/9/4813/6576362
[18] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24755934/
[19] en.wikipedia.org/wiki/Protein
PRC1の構造と機能
PRC1の基本構造
Polycomb Repressive Complex 1 (PRC1)は、遺伝子発現の抑制に重要な役割を果たす多タンパク質複合体です。PRC1は、いくつかの異なるサブユニットから構成され、その組成により機能が異なります。以下に、PRC1の基本構造と主要なサブユニットについて詳述します。
1. RING1A/B
RING1AおよびRING1Bは、PRC1の中心的な構成要素であり、E3ユビキチンリガーゼ活性を持ちます。これにより、ヒストンH2Aのリジン119(H2AK119)をユビキチン化し、遺伝子発現を抑制します[1][4][6][10][20]。
2. BMI1
BMI1(B cell-specific Moloney murine leukemia virus integration site 1)は、PRC1の構造的なサブユニットであり、RING1A/Bと相互作用して複合体の安定性を高め、H2Aのユビキチン化活性を促進します[10][12]。BMI1は、幹細胞の自己複製と分化においても重要な役割を果たします[11]。
3. PHC
PHC(Polyhomeotic homologues)は、PRC1のサブユニットであり、クロマチンの構造を変化させる役割を持ちます。PHCは、SAMドメインを介してDNAループを形成し、クロマチンの局所的なコンパクションを引き起こします[4][10]。
4. CBX
CBX(Chromobox)は、PRC1のサブユニットであり、H3K27me3マークに結合することでPRC1をクロマチンにリクルートします。CBXファミリーには、CBX2、CBX4、CBX6、CBX7、CBX8が含まれ、それぞれ異なる機能を持ちます[4][6][10]。
5. PCGF
PCGF(Polycomb group RING finger)は、PRC1のサブユニットであり、PCGF1からPCGF6までの6つの異なるメンバーがあります。これらのPCGFサブユニットは、PRC1の機能とターゲット認識に影響を与えます。例えば、PCGF1はクロマチンの安定な結合を促進し、PCGF2はPolycombボディに豊富に存在します[1][4][5][6][7]。
● PRC1の機能的分類
PRC1は、構成するサブユニットに基づいて、以下のように分類されます。
1. カノニカルPRC1(cPRC1)
カノニカルPRC1は、CBXおよびPHCサブユニットを含み、主にクロマチンの構造を変化させる役割を持ちます。cPRC1は、H3K27me3マークに結合し、クロマチンのコンパクションを引き起こします[4][6][10]。
2. バリアントPRC1(vPRC1)
バリアントPRC1は、RYBPまたはYAF2とPCGF1、3、5、6のいずれかを含み、主にH2AK119のユビキチン化を促進します。vPRC1は、PRC2やH3K27me3に依存せずにターゲットにリクルートされます[1][4][6][7][9]。
● 結論
PRC1は、RING1A/B、BMI1、PHC、CBXなどのサブユニットから構成され、これらのサブユニットの組み合わせにより、クロマチンの構造変化や遺伝子発現の抑制などの多様な機能を果たします。PRC1の構造と機能の理解は、エピジェネティックな遺伝子制御のメカニズムを解明するために重要です。
- 参考文献・出典
-
[1] www.nature.com/articles/s41467-021-21130-6
[2] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34608337/
[3] www.mdpi.com/1422-0067/21/22/8594
[4] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6859790/
[5] www.nature.com/articles/s41467-022-34856-8
[6] www.nature.com/articles/s41467-023-42507-9
[7] elifesciences.org/articles/17667
[8] www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.11.16.567444v1.full
[9] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24856970/
[10] www.nature.com/articles/ncomms13343
[11] bmcmolcellbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2121-15-18
[12] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8210184/
[13] genesdev.cshlp.org/content/35/5-6/301.full
[14] www.youtube.com/watch?v=CmYlI_9VkA0
[15] www.science.org/doi/10.1126/sciadv.1500737
[16] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9181254/
[17] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0301472X16307743
[18] www.nature.com/articles/s42003-023-05501-x
[19] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37487640/
[20] www.nature.com/articles/s41586-022-04598-0
PRC1の主要機能
Polycomb Repressive Complex 1 (PRC1)は、エピジェネティックな遺伝子サイレンシングにおいて重要な役割を果たす多タンパク質複合体です。以下に、PRC1の主要な機能を詳述します。
1. ヒストンH2Aのユビキチン化
PRC1は、ヒストンH2Aのリジン119(H2AK119)をユビキチン化するE3ユビキチンリガーゼ活性を持っています。この修飾は、遺伝子発現の抑制に重要です。PRC1のサブユニットであるRING1A/Bがこのユビキチン化を媒介し、これによりクロマチンの構造が変化し、遺伝子のサイレンシングが促進されます[3][4][6][7][13]。
2. クロマチンの凝縮
PRC1は、クロマチンを凝縮させることで遺伝子発現を抑制します。特に、PRC1はクロマチンの局所的なコンパクションを引き起こし、遺伝子の転写を物理的に阻害します。この機能は、PRC1のサブユニットであるCBX2やPHCによって媒介されます[1][2][7][9]。
3. エピジェネティック記憶の維持
PRC1は、エピジェネティックな記憶を維持するために重要な役割を果たします。PRC1によるH2AK119のユビキチン化は、PRC2によるH3K27のトリメチル化と協調して機能し、これにより遺伝子のサイレンシングが長期間にわたって維持されます。この相互作用は、細胞分裂を通じて遺伝子サイレンシングを伝播するためのフィードバックメカニズムを形成します[5][8][16]。
4. 細胞分化と発生の調節
PRC1は、細胞分化と発生の過程において重要な役割を果たします。特に、PRC1は幹細胞のアイデンティティを維持し、適切なタイミングでの分化を促進します。例えば、PRC1は神経細胞の分化や血液細胞の発生において重要な役割を果たします[10][14][15][20]。
5. クロマチン構造の調節
PRC1は、クロマチンの三次元構造を調節することで、遺伝子発現を制御します。PRC1は、クロマチンループの形成やクロマチンドメインの境界を設定することで、遺伝子の転写活性を調節します[7][17]。
● 結論
PRC1は、ヒストンH2Aのユビキチン化を介してクロマチンを凝縮させ、遺伝子発現を抑制する主要なエピジェネティック修飾因子です。また、PRC1は他のエピジェネティック修飾因子と協力して、遺伝子のサイレンシングを維持し、細胞分化や発生の過程を調節します。これらの機能により、PRC1は細胞のアイデンティティと機能を維持するために不可欠な役割を果たしています。
- 参考文献・出典
-
[1] www.nature.com/articles/s41467-021-26147-5
[2] www.mdpi.com/1420-3049/29/2/323
[3] www.nature.com/articles/s41467-020-19722-9
[4] www.nature.com/articles/s41594-024-01258-x
[5] www.nature.com/articles/s41467-023-35859-9
[6] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22844243/
[7] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6859790/
[8] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31036804/
[9] www.nature.com/articles/s41467-022-34856-8
[10] elifesciences.org/articles/72769
[11] genesdev.cshlp.org/content/35/5-6/301.full
[12] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24793759/
[13] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32196702/
[14] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0301472X16307743
[15] www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.11.16.567444v1.full
[16] www.nature.com/articles/s41467-019-09628-6
[17] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1534580713005030
[18] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38088808/
[19] journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371%2Fjournal.pgen.1010209
[20] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34994686/
PRC2の構造と機能
PRC2の基本構造
Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2)は、エピジェネティックな遺伝子発現制御に重要な役割を果たす多タンパク質複合体です。PRC2は主に以下のサブユニットから構成されています。
1. EZH1/EZH2
EZH1とEZH2は、PRC2の触媒サブユニットであり、ヒストンH3のリジン27(H3K27)のメチル化を触媒します。EZH1とEZH2はほぼ同じ機能を持ちますが、発現パターンが異なります[1][2][7]。
2. EED
EEDは、H3K27me3に結合し、PRC2をクロマチンにリクルートします。また、EZH1/2のメチル化活性を刺激する役割も持ちます[1][2][3]。
3. SUZ12
SUZ12は、PRC2の構造的な整合性と安定性を維持し、EZH1/2との結合を介してメチル化活性を制御します。SUZ12のC末端VEFS領域がEZH1/2と結合します[1][3][5]。
4. RBBP4/RBBP7
RBBP4とRBBP7は、ヒストンシャペロンとして機能し、PRC2をヌクレオソームに結合させる役割を持ちます[1][2][3]。
5. 補助サブユニット
PRC2には、上記の中心的なサブユニット以外にも、AEBP2、JARID2、MTF2、PHF1、PHF19などの補助的なサブユニットが存在します。これらの補助サブユニットは、PRC2の活性、クロマチン結合能、標的遺伝子特異性を調節します[4][5][6][8]。
PRC2は、中心的なサブユニットの組み合わせと補助サブユニットの有無によって、いくつかの異なる構造的バリアントが存在します。
– PRC2.1: MTF2、PHF1、PHF19などを含む
– PRC2.2: AEBP2、JARID2を含む
これらのバリアントは、異なる細胞種や発生段階で発現し、PRC2の機能を調節していると考えられています[5][6]。
PRC2の構造と構成サブユニットの理解は、エピジェネティックな遺伝子発現制御メカニズムを解明する上で重要です。PRC2の異常は、様々な疾患、特に癌との関連が指摘されており、PRC2を標的とした治療法の開発が期待されています。
- 参考文献・出典
-
[1] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5519257/
[2] www.nature.com/articles/ncomms11384
[3] www.nature.com/articles/s41467-022-34431-1
[4] academic.oup.com/nar/article/50/4/1969/6523809
[5] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8217195/
[6] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004223010532
[7] www.bmbreports.org/journal/view.html?vmd=Full
[8] www.cell.com/molecular-cell/pdf/S1097-2765%2819%2930949-9.pdf
PRC2の主要機能
Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2)は、遺伝子発現のエピジェネティックな抑制に重要な役割を果たす複合体です。PRC2の主要な機能は以下の通りです。
1. ヒストンH3のリジン27のメチル化
PRC2は、ヒストンH3のリジン27(H3K27)にメチル基を付加することで知られています。特に、H3K27のトリメチル化(H3K27me3)は、遺伝子のサイレンシングのエピジェネティックなマーカーとして機能します[1][2][3]。このメチル化は、遺伝子の転写を抑制し、細胞分化や発生過程での遺伝子発現パターンの維持に寄与します。
2. クロマチンのコンパクション
PRC2の活性は、クロマチン構造のコンパクションを促進し、遺伝子の発現を抑制することにも関連しています。特に、H3K27me3は、PRC1複合体のリクルートメントに役立ち、これがクロマチンのさらなるコンパクションと遺伝子のサイレンシングを促進します[4][5][8]。
3. 遺伝子発現の抑制
PRC2によるH3K27のメチル化は、ターゲット遺伝子の発現を直接的に抑制します。このプロセスは、細胞のアイデンティティを維持し、不適切な遺伝子発現が起こることを防ぐために重要です[1][2][3]。
4. 発生と細胞分化の調節
PRC2は、発生過程や細胞分化において重要な役割を果たします。特に、PRC2は幹細胞のプログラムを維持し、分化に必要な遺伝子の発現を抑制することで、細胞の運命決定に寄与します[1][2][3]。
5. 疾患との関連
PRC2の機能不全は、がんや発達障害などの疾患と関連しています。特に、H3K27me3の異常なパターンは、遺伝子の不適切なサイレンシングや活性化につながり、細胞の異常な増殖や分化不全を引き起こす可能性があります[1][2][3]。
● 結論
PRC2は、ヒストンH3のリジン27のメチル化を介してクロマチンのコンパクションを促進し、ターゲット遺伝子の発現を抑制することで、細胞のアイデンティティの維持、発生と細胞分化の調節、さらには疾患の発生に至るまで、多岐にわたる生物学的プロセスに影響を与えます。
- 参考文献・出典
-
[1] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9255955/
[2] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8119337/
[3] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276519301856
[4] www.cell.com/trends/genetics/abstract/S0168-9525%2820%2930336-X
[5] www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S016895252030336X
[6] www.nature.com/articles/s41467-019-09624-w
[7] genesdev.cshlp.org/content/36/19-20/1043.full.html
[8] www.researchgate.net/publication/348703053_Polycomb_Gene_Silencing_Mechanisms_PRC2_Chromatin_Targeting_H3K27me3_%27Readout%27_and_Phase_Separation-Based_Compaction
PcGとエピジェネティクス
エピジェネティックな遺伝子サイレンシング
Polycomb Group (PcG)タンパク質は、エピジェネティックな修飾を通じて遺伝子発現を抑制する重要な役割を果たします。これらのタンパク質は、ヒストン修飾とDNAメチル化を介して、長期間にわたり遺伝子サイレンシングを維持します。
1. ヒストン修飾
PcGタンパク質は、主にヒストンH3のリジン27(H3K27)のメチル化とヒストンH2Aのリジン119(H2AK119)のユビキチン化を介して遺伝子サイレンシングを行います。
– PRC2(Polycomb Repressive Complex 2): PRC2は、EZH2という触媒サブユニットを含み、H3K27のメチル化を行います。この修飾は、遺伝子の転写を抑制するエピジェネティックマーカーとして機能します[1][2][3][9]。
– PRC1(Polycomb Repressive Complex 1): PRC1は、RING1A/Bというサブユニットを含み、H2AK119のユビキチン化を行います。この修飾は、クロマチンの構造を変化させ、遺伝子の転写を物理的に阻害します[1][4][9][20]。
2. DNAメチル化
DNAメチル化は、遺伝子サイレンシングのもう一つの重要なメカニズムです。CpGアイランドと呼ばれるDNA領域にメチル基が付加されることで、遺伝子の転写が抑制されます。
– DNAメチル化の役割: DNAメチル化は、ヒストン修飾と相互作用し、クロマチンのコンパクションを促進します。これにより、転写因子がDNAにアクセスできなくなり、遺伝子の発現が抑制されます[2][4][6][10][18]。
3. 長期的な遺伝子サイレンシングの維持
PcGタンパク質によるエピジェネティックな修飾は、細胞分裂を通じて遺伝子サイレンシングを維持します。これにより、細胞のアイデンティティが維持され、適切な遺伝子発現パターンが保たれます。
– エピジェネティックな記憶: PRC2によるH3K27me3とPRC1によるH2AK119ub1は、エピジェネティックな記憶を形成し、遺伝子サイレンシングを長期間にわたって維持します[1][4][7][9]。
4. 疾患との関連
エピジェネティックな遺伝子サイレンシングの異常は、がんや発達障害などの疾患と関連しています。特に、腫瘍抑制遺伝子のサイレンシングは、がんの進行に寄与します[4][10][14][18]。
● 結論
PcGタンパク質は、ヒストン修飾とDNAメチル化を介して、遺伝子発現をエピジェネティックに抑制する重要な役割を果たします。これにより、細胞のアイデンティティと機能が維持され、発生や分化の過程が適切に調節されます。エピジェネティックな遺伝子サイレンシングの理解は、疾患の治療や予防においても重要です。
- 参考文献・出典
-
[1] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3662373/
[2] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16098738/
[3] www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0959437X05001322
[4] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC289180/
[5] www.frontiersin.org/journals/plant-science/articles/10.3389/fpls.2015.00693/full
[6] www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK532999/
[7] cshperspectives.cshlp.org/content/6/11/a019331.full
[8] www.nature.com/articles/s41586-024-07087-8
[9] www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2024.1383200/full
[10] www.nature.com/articles/nrc1799
[11] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2405471222004914
[12] www.nature.com/articles/s41559-018-0781-2
[13] www.nature.com/articles/s41467-021-27345-x
[14] www.nature.com/articles/s41422-021-00606-6
[15] www.sci.hokudai.ac.jp/Cellfunction_Structure3/journal-club/
[16] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1016847823053827
[17] www.frontiersin.org/journals/plant-science/articles/10.3389/fpls.2013.00454/full
[18] www.nature.com/scitable/topicpage/the-role-of-methylation-in-gene-expression-1070/
[19] www.takara-bio.co.jp/research/epi/pdfs/epi_0a.pdf
[20] www.nature.com/articles/s41467-020-19722-9
クロマチン修飾における役割
Polycomb Group (PcG)複合体は、クロマチンの構造を動的に変化させ、遺伝子発現の調節を行う重要な役割を果たします。特に、PRC1(Polycomb Repressive Complex 1)とPRC2(Polycomb Repressive Complex 2)の協働により、クロマチンのリモデリングが実現し、遺伝子のサイレンシングが強化されます。
● PRC2の役割
PRC2は、ヒストンH3のリジン27(H3K27)のメチル化を行うヒストンメチルトランスフェラーゼです。このメチル化は、H3K27me3として知られ、遺伝子のサイレンシングに重要なエピジェネティックマーカーです[1][2][3]。PRC2は、以下のようなメカニズムでクロマチン修飾を行います。
– H3K27のメチル化: PRC2は、H3K27のモノ、ジ、トリメチル化を触媒し、これによりクロマチンの構造を変化させ、遺伝子の転写を抑制します[1][2][3]。
– クロマチンのコンパクション: PRC2によるH3K27me3は、クロマチンのコンパクションを促進し、遺伝子の発現を物理的に抑制します[4][5][8]。
– PRC1のリクルートメント: H3K27me3は、PRC1をクロマチンにリクルートする役割も果たします。これにより、さらなるクロマチン修飾が行われます[2][3][6]。
● PRC1の役割
PRC1は、ヒストンH2Aのリジン119(H2AK119)のユビキチン化を行うE3ユビキチンリガーゼ活性を持ちます。この修飾は、クロマチンのさらなるコンパクションと遺伝子サイレンシングを促進します[1][4][9][20]。PRC1は、以下のようなメカニズムでクロマチン修飾を行います。
– H2AK119のユビキチン化: PRC1は、RING1A/Bサブユニットを介してH2AK119をユビキチン化し、これによりクロマチンの構造を変化させます[1][4][9][20]。
– クロマチンのコンパクション: PRC1は、クロマチンの局所的なコンパクションを引き起こし、遺伝子の転写を物理的に阻害します[1][4][9][20]。
– 相互作用とフィードバックループ: PRC1とPRC2は、相互作用しながらフィードバックループを形成し、エピジェネティックな記憶を維持します。例えば、PRC1によるH2AK119のユビキチン化は、PRC2のH3K27メチル化を促進します[5][6][9]。
● 協働によるクロマチンリモデリング
PRC1とPRC2の協働により、クロマチンのリモデリングが実現し、遺伝子のサイレンシングが強化されます。具体的には、以下のようなプロセスが関与しています。
– クロマチンのコンパクション: PRC2によるH3K27me3とPRC1によるH2AK119のユビキチン化が協調してクロマチンのコンパクションを促進し、遺伝子の発現を抑制します[1][4][9][20]。
– エピジェネティックな記憶の維持: PRC1とPRC2の相互作用により、エピジェネティックな記憶が維持され、細胞分裂を通じて遺伝子サイレンシングが伝播されます[1][4][7][9]。
● 結論
PcG複合体は、クロマチンの構造を動的に変化させ、遺伝子発現の調節を行う重要な役割を果たします。特に、PRC1とPRC2の協働により、クロマチンのリモデリングが実現し、遺伝子のサイレンシングが強化されます。これにより、細胞のアイデンティティと機能が維持され、発生や分化の過程が適切に調節されます。
- 参考文献・出典
-
[1] www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0959437X16301770
[2] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6452890/
[3] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276519301856
[4] www.nature.com/articles/s41467-020-20775-z
[5] www.nature.com/articles/s41594-024-01258-x
[6] www.nature.com/articles/s41467-021-26147-5
[7] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1934590914001933
[8] www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S016895252030336X
[9] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33494958/
[10] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8119337/
[11] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30154222/
[12] www.nature.com/articles/s41467-019-09624-w
[13] www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.04.27.441584v1.full
[14] www.cell.com/trends/genetics/abstract/S0168-9525%2820%2930336-X
[15] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8408974/
[16] www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.06.29.450346v1.full
[17] www.nature.com/articles/s41586-022-04598-0
[18] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35617427/
[19] www.nature.com/articles/s41422-021-00606-6
[20] bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-020-02384-6
PcGと関連疾患
がんとの関連性
Polycomb Group (PcG)タンパク質は、正常な細胞分化と発生において重要な役割を果たしていますが、その異常はがんの発症と進行に深く関与しています。
● PRC1の役割
– BMI1の過剰発現: 多くのがん種で見られ、がん幹細胞の自己複製能や不死化を促進します[1][3][6]。
– CBX7の機能不全: 腫瘍抑制的に働き、CBX7の発現低下はがんの進行に関与します[4][9]。
– RING1A/Bの異常: RING1Bは主にがん細胞で過剰発現し、RING1Aは発現低下が見られます。RING1Bは腫瘍形成を促進し、RING1Aは抑制的に働きます[7][10]。
● PRC2の役割
– EZH2の過剰発現: 多くのがん種で見られ、H3K27me3を介して遺伝子発現を抑制し、増殖や転移を促進します[2][5][18]。
– EZH2の活性化変異: 特にリンパ腫で見られ、H3K27me3レベルを上昇させ、がん抑制遺伝子を不活化します[5][18]。
– EZH2の不活化変異: 骨髄異形成症候群などで見られ、EZH2が腫瘍抑制的に機能することを示唆します[18]。
● その他の役割
– PRC1/2の構成要素の変異: 様々ながん種でPRC1/2の構成要素に変異が見られ、クロマチン構造や遺伝子発現に影響を与えます[7][9][10]。
– PRC1/2の標的遺伝子の発現変化: PRC1/2の異常は、増殖、生存、分化、老化に関わる遺伝子の発現に影響を与えます[1][2][3][5]。
PcGタンパク質の異常は、エピジェネティックな制御の破綻を引き起こし、がんの発症や進行に深く関与しています。PcGタンパク質は、がん治療の新たな分子標的となる可能性があります。
- 参考文献・出典
-
[1] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3662373/
[2] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5008062/
[3] www.nature.com/articles/s41422-021-00606-6
[4] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31177918/
[5] www.nature.com/articles/s41586-024-07328-w
[6] link.springer.com/article/10.1631/jzus.B1400077
[7] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9455514/
[8] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24793759/
[9] academic.oup.com/narcancer/article/3/4/zcab039/6381044
[10] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8489530/
[11] www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2024.1383200/full
[12] www.nature.com/articles/nsmb.2669
[13] www.nature.com/articles/s41467-023-39990-5
[14] www.frontiersin.org/journals/oncology/articles/10.3389/fonc.2023.1216289/full
[15] www.mdpi.com/2073-4425/11/3/287
[16] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0753332223016955
[17] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31837995/
[18] biomarkerres.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40364-018-0122-2
[19] www.thelancet.com/journals/ebiom/article/PIIS2352-3964%2824%2900007-0/fulltext
[20] www.mpipz.mpg.de/turck/project_1
発達障害や神経疾患との関連性
Polycomb Group (PcG)タンパク質の機能不全は、発達障害や神経変性疾患に深く関連しています。以下に、これらの疾患における具体的なメカニズムと治療の可能性について解説します。
● 発達障害におけるPcGタンパク質の役割
1. 神経発達の調節:
– PcGタンパク質は、神経発達の過程で重要な役割を果たします。特に、PRC2はヒストンH3のリジン27(H3K27)のメチル化を介して、神経前駆細胞の分化と増殖を調節します[1][2][3]。
– PRC1は、ヒストンH2Aのリジン119(H2AK119)のユビキチン化を通じて、クロマチンの構造を変化させ、遺伝子発現を抑制します[1][4][9][20]。
2. 発達障害との関連:
– PcGタンパク質の異常は、神経発達障害と関連しています。例えば、EZH2の変異は、神経発達障害や自閉症スペクトラム障害(ASD)と関連しています[1][2][3]。
– ASXL3の新規変異は、Bohring-Opitz症候群に類似した新しい臨床表現型と関連しています[1][2]。
● 神経変性疾患におけるPcGタンパク質の役割
1. 神経変性のメカニズム:
– PcGタンパク質の機能不全は、神経変性疾患の進行に寄与します。例えば、PRC2の欠損は、神経細胞の異常な遺伝子発現を引き起こし、神経変性を促進します[5][7]。
– PRC1の構成要素であるBMI1のサイレンシングは、アルツハイマー病(AD)や他の神経変性疾患と関連しています[5][7]。
2. 具体的な疾患との関連:
– アルツハイマー病(AD): PRC2の欠損は、ADにおいて神経細胞の死を促進する遺伝子の異常な発現を引き起こします[5][7]。
– パーキンソン病(PD): クロマチン調節因子の異常は、PDの病態進行に寄与します。特に、PCGF5やRYBPなどの遺伝子は、PDの免疫機能と関連しています[9]。
– ハンチントン病(HD): PRC2の機能不全は、HDにおける神経細胞の異常な遺伝子発現を引き起こし、病態進行に寄与します[5][7]。
● 治療の可能性
1. エピジェネティックな治療:
– PcGタンパク質の機能を回復させるエピジェネティックな治療法が研究されています。例えば、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤やDNAメチル化阻害剤が、神経変性疾患の治療に有望です[18][19]。
– 小分子化合物やCRISPR技術を用いたエピジェネティックな編集も、発達障害や神経変性疾患の治療に向けた新しいアプローチとして注目されています[1][2][3][5]。
2. 遺伝子治療:
– PcGタンパク質の異常を修正するための遺伝子治療も研究されています。特に、BMI1やEZH2の発現を調節する遺伝子治療が、神経変性疾患の進行を遅らせる可能性があります[1][2][3][5]。
● 結論
PcGタンパク質の機能不全は、発達障害や神経変性疾患に深く関連しており、これらの疾患のメカニズム解明と治療法開発において重要なターゲットとなっています。エピジェネティックな治療法や遺伝子治療の進展により、これらの疾患に対する新しい治療戦略が期待されています。
- 参考文献・出典
-
[1] onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/dneu.22876
[2] onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/dneu.22876
[3] pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35384339/
[4] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9698227/
[5] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8078026/
[6] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6770078/
[7] www.mdpi.com/2075-4655/1/3/21
[8] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7332613/
[9] www.nature.com/articles/s41598-023-30236-4
[10] www.nature.com/articles/s41392-024-01743-1
[11] actaneurocomms.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40478-014-0093-y
[12] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9950662/
[13] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3654311/
[14] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8801496/
[15] www.mdpi.com/1422-0067/22/19/10312
[16] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1534580720307164
[17] www.cell.com/trends/neurosciences/pdf/S0166-2236%2810%2900055-X.pdf
[18] fluidsbarrierscns.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12987-021-00250-7
[19] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9564880/
[20] www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0278584617305389
最新の研究動向
新しいPcG関連タンパク質の発見
最近の研究により、Polycomb Group (PcG)タンパク質に関連する新しいタンパク質が発見され、その特性と機能が明らかになってきました。これらの発見は、PcGタンパク質の多様な役割を理解し、新たな治療ターゲットの可能性を示しています。
1. Crol (Crooked legs)
– 特性: Crolは、PRE(Polycomb Response Element)結合タンパク質Cgと直接相互作用することが示されています。CgはPRC1複合体と密接に関連しており、Crolはこの相互作用を通じてPcG依存的な転写抑制に関与します[5]。
– 機能: Crolは、エクジソン誘導性の抑制因子として機能し、特に*wg*(wingless)遺伝子の転写を抑制します。また、CrolのノックダウンはPolycombボディの形成を妨げることが示されています[5]。
2. TRBs (Telomere Repeat Binding Factors)
– 特性: TRBsは、テロボックスモチーフに結合し、Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2)を標的領域にリクルートする役割を持ちます。これにより、H3K27me3の堆積が促進されます[13]。
– 機能: TRBsは、テロメアの繰り返し配列に結合することで知られており、テロメアとPcG標的遺伝子の間で競合が生じる可能性があります。TRBsは、植物の発生過程におけるPcG依存的な遺伝子調節に重要な役割を果たします[13]。
3. KDM2B
– 特性: KDM2Bは、非カノニカルPRC1(ncPRC1)の構成要素であり、無メチル化CpG二核酸に結合するCxxCドメインを持ちます。これにより、PRC2によるH3K27me3の堆積が促進され、その後のカノニカルPRC1(cPRC1)のリクルートメントが行われます[17]。
– 機能: KDM2Bは、DNAメチル化機構と連携して、遺伝子発現のエピジェネティックな制御を行います。特に、幹細胞の機能維持や臓器発生において重要な役割を果たします[17]。
● 新たな治療ターゲットの可能性
これらの新しいPcG関連タンパク質の発見は、エピジェネティックな制御メカニズムの理解を深めるだけでなく、がんや神経疾患などの治療における新たなターゲットとしての可能性を示しています。
– Crol: PcG依存的な転写抑制に関与するため、がん治療における新たなターゲットとして注目されています[5]。
– TRBs: 植物の発生過程における遺伝子調節に重要な役割を果たすため、農業分野での応用が期待されます[13]。
– KDM2B: 幹細胞の機能維持や臓器発生において重要な役割を果たすため、再生医療やがん治療における新たなターゲットとしての可能性があります[17]。
● 結論
新しいPcG関連タンパク質の発見は、PcGタンパク質の多様な役割を理解し、新たな治療ターゲットの可能性を示しています。これにより、エピジェネティックな制御メカニズムの解明と疾患治療の進展が期待されます。
- 参考文献・出典
-
[1] spacemedia.jp/spacebis/10475
[2] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4718713/
[3] www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2024.1383200/full
[4] www.biol.tsukuba.ac.jp/tjb/Vol16No1/TJBvol16no1_ver20170217.pdf
[5] academic.oup.com/nar/article/51/12/6087/7151342
[6] www.nature.com/articles/s41422-021-00606-6
[7] academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae271/7655789?login=false
[8] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7800605/
[9] kaken.nii.ac.jp/ja/file/KAKENHI-AREA-3803/3803_jigo_hyoka_hokoku_ja.pdf
[10] spc.jst.go.jp/hottopics/1101stem_cell_regenerative/r1101_iwama.html
[11] www.link-j.org/event/post-3782.html
[12] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9354779/
[13] www.mpipz.mpg.de/turck/project_1
[14] www.science.org/doi/10.1126/sciadv.1500737
[15] www.nature.com/articles/s41586-024-07328-w
[16] www.riken.jp/press/2021/20210406_1/
[17] www.riken.jp/en/research/labs/ims/dev_genet/index.html
[18] iplasticity.umin.jp/file/iPlasticity_NL3.pdf
[19] journals.lww.com/md-journal/fulltext/2024/01260/research_progress_in_intratumoral_heterogeneity.54.aspx
[20] www.natureasia.com/ja-jp/nplants/articles
PcGを標的とした治療法の開発
最近の研究により、Polycomb Group (PcG)タンパク質に関連する新しいタンパク質が発見され、その特性と機能が明らかになってきました。これらの発見は、PcGタンパク質の多様な役割を理解し、新たな治療ターゲットの可能性を示しています。
● 1. Crol (Crooked legs)
– 特性: Crolは、PRE(Polycomb Response Element)結合タンパク質Cgと直接相互作用することが示されています。CgはPRC1複合体と密接に関連しており、Crolはこの相互作用を通じてPcG依存的な転写抑制に関与します[5]。
– 機能: Crolは、エクジソン誘導性の抑制因子として機能し、特に*wg*(wingless)遺伝子の転写を抑制します。また、CrolのノックダウンはPolycombボディの形成を妨げることが示されています[5]。
● 2. TRBs (Telomere Repeat Binding Factors)
– 特性: TRBsは、テロボックスモチーフに結合し、Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2)を標的領域にリクルートする役割を持ちます。これにより、H3K27me3の堆積が促進されます[13]。
– 機能: TRBsは、テロメアの繰り返し配列に結合することで知られており、テロメアとPcG標的遺伝子の間で競合が生じる可能性があります。TRBsは、植物の発生過程におけるPcG依存的な遺伝子調節に重要な役割を果たします[13]。
● 3. KDM2B
– 特性: KDM2Bは、非カノニカルPRC1(ncPRC1)の構成要素であり、無メチル化CpG二核酸に結合するCxxCドメインを持ちます。これにより、PRC2によるH3K27me3の堆積が促進され、その後のカノニカルPRC1(cPRC1)のリクルートメントが行われます[17]。
– 機能: KDM2Bは、DNAメチル化機構と連携して、遺伝子発現のエピジェネティックな制御を行います。特に、幹細胞の機能維持や臓器発生において重要な役割を果たします[17]。
● 新たな治療ターゲットの可能性
これらの新しいPcG関連タンパク質の発見は、エピジェネティックな制御メカニズムの理解を深めるだけでなく、がんや神経疾患などの治療における新たなターゲットとしての可能性を示しています。
– Crol: PcG依存的な転写抑制に関与するため、がん治療における新たなターゲットとして注目されています[5]。
– TRBs: 植物の発生過程における遺伝子調節に重要な役割を果たすため、農業分野での応用が期待されます[13]。
– KDM2B: 幹細胞の機能維持や臓器発生において重要な役割を果たすため、再生医療やがん治療における新たなターゲットとしての可能性があります[17]。
● 結論
新しいPcG関連タンパク質の発見は、PcGタンパク質の多様な役割を理解し、新たな治療ターゲットの可能性を示しています。これにより、エピジェネティックな制御メカニズムの解明と疾患治療の進展が期待されます。
- 参考文献・出典
-
[1] spacemedia.jp/spacebis/10475
[2] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4718713/
[3] www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcell.2024.1383200/full
[4] www.biol.tsukuba.ac.jp/tjb/Vol16No1/TJBvol16no1_ver20170217.pdf
[5] academic.oup.com/nar/article/51/12/6087/7151342
[6] www.nature.com/articles/s41422-021-00606-6
[7] academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae271/7655789?login=false
[8] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7800605/
[9] kaken.nii.ac.jp/ja/file/KAKENHI-AREA-3803/3803_jigo_hyoka_hokoku_ja.pdf
[10] spc.jst.go.jp/hottopics/1101stem_cell_regenerative/r1101_iwama.html
[11] www.link-j.org/event/post-3782.html
[12] www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9354779/
[13] www.mpipz.mpg.de/turck/project_1
[14] www.science.org/doi/10.1126/sciadv.1500737
[15] www.nature.com/articles/s41586-024-07328-w
[16] www.riken.jp/press/2021/20210406_1/
[17] www.riken.jp/en/research/labs/ims/dev_genet/index.html
[18] iplasticity.umin.jp/file/iPlasticity_NL3.pdf
[19] journals.lww.com/md-journal/fulltext/2024/01260/research_progress_in_intratumoral_heterogeneity.54.aspx
[20] www.natureasia.com/ja-jp/nplants/articles