High mobility group (HMG) box
高移動度群（HMG）ボックスタンパク質は、細胞内に豊富に存在するユビキタスなDNA結合タンパク質であり、その機能は驚くほど多岐にわたっている。HMG-boxのDNA結合ドメインの構造や、DNAの結合と屈曲の一般的なメカニズムは前から知られていた。しかし、HMG-boxタンパク質の細胞内移行を制御する新たなメカニズムや、HMG-boxタンパク質が配列特異性の有無にかかわらずDNAを認識するメカニズムは、ごく最近になって明らかになった。これらのタンパク質では、HMG-boxタンパク質のモジュール性、他のDNA結合タンパク質や細胞内受容体との相互作用、および翻訳後修飾が、その多様な機能を制御する鍵となっていることが、構造的・生化学的研究によって明らかにされている。
高移動度グループ（HMG）ボックスドメインは、DNAの結合に関与しているほか、タンパク質間の相互作用にも関与している可能性がある。HMG-boxドメインは、3つのらせんが不規則に並んだ構造をしている。HMG-boxドメインは、HMG-boxタンパク質に1つ以上含まれている。HMG-boxタンパク質は、転写、複製、鎖の修復などのDNA依存プロセスの制御に関与する大規模で多様なファミリーを形成しており、これらのプロセスはすべてクロマチンの曲げ伸ばしを必要とする。これらのタンパク質の多くは、遺伝子発現を制御している。HMG-boxタンパク質は様々な真核生物に存在し、配列に依存したDNA認識と配列に依存しないDNA認識の2つのグループに大別される。前者は通常1つのHMG-boxモチーフを持ち、後者は複数のHMG-boxモチーフを持つことがある。
HMG-boxドメインは、以下のタンパク質クラスに単一または複数存在する。
- HMG1
- HMG2
- クロマチンの非ヒストン成分
- 性腺形成の差異に関与するSRY（sex determining region Y protein）
- 転写因子のSOXファミリー
- 器官形成や胸腺細胞の分化の制御に関与する配列特異的LEF1（lymphoid enhancer binding factor 1）
- TCF-1（T-cell factor 1）
- 転写および複製に関与する構造特異的認識タンパク質SSRP
- MTF1ミトコンドリア転写因子
- RNAポリメラーゼIによる転写に関与する核小胞体転写因子UBF 1/2（upstream binding factor）
- Abf2酵母ARS結合因子
- 酵母の転写因子lxr1，Rox1，Nhp6b，Spp41，
- 真菌の有性生殖に関与する交配型タンパク質（MAT）
- 植物特異的転写因子YABBY
