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HOXB13遺伝子
HOXB13遺伝子産物は、RNAポリメラーゼII特異的なDNA結合転写抑制活性、メチルCpG結合活性、配列特異的な二本鎖DNA結合活性を可能にする。血管新生やRNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御に関与する。核質内に存在する。乳管がんや腎細胞がんに関与する。子宮頸癌、子宮内膜癌、前立腺癌のバイオマーカー。
承認済シンボル：
遺伝子名：
参照：
一次ソース
遺伝子OMIM番号604607
Ensembl :
minerva-clinic.or.jp/wp-admin/post-new.php?post_type=campaign
AllianceGenome : HGNC : 5112
遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
遺伝子のグループ：
遺伝子座:
HOXB13遺伝子の機能
（参照）
この遺伝子は、ホメオボックス遺伝子ファミリーに属する転写因子をコードしている。このファミリーの遺伝子は、脊椎動物の間で高度に保存されており、脊椎動物の胚発生に必須である。この遺伝子は、胎児の皮膚の発達や皮膚の再生に関与していることが示唆されている。マウスでは、同様の遺伝子が胚の主体軸に時間的・空間的な共線性を示すが、副軸には発現しないことから、軸に沿った体のパターニングに機能することが示唆された。この遺伝子は、他のHOXB遺伝子とともに染色体17q21-22領域に遺伝子クラスターを形成している。2008年7月、RefSeqにより提供された。
HOXB13遺伝子の発現
前立腺（RPKM 57.5）および結腸（RPKM 27.9）で偏った発現を示す
HOXB13遺伝子と関係のある疾患
※OMIIMの中括弧”{ }”は、多因子疾患または感染症に対する感受性に寄与する変異を示す。[ ]は「非疾患」を示し、主に検査値の異常をもたらす遺伝的変異を示す。クエスチョンマーク”? “は、表現型と遺伝子の関係が仮のものであることを示す。
{Prostate cancer, hereditary, 9}
610997 3
遺伝性前立腺癌9（HPC9）に対する感受性が染色体17q21-q22上のHOXB13遺伝子（604607）の変異と関連しているという証拠から、この項目には番号記号（#）が使用されてる。エントリ番号の前の数字記号(#)は、記述的なエントリであること、通常は表現型であり、固有の遺伝子座を表さないことを示す。
Langeら（2003年）は、前立腺がんを有する175の血統について連鎖解析を行ったが、そのほとんどは3人以上の罹患者を含んでいた。染色体17qに遺伝子座の候補が同定され（ノンパラメトリックロッドスコア2.36）、4人以上の罹患者を持つ血統のサブセットから最も強い証拠が得られた（ノンパラメトリックロッドスコア3.27）。
Langeら（2003年）が解析した175の血統を含む、前立腺がんを有する453の血統の連鎖解析により、Langeら（2007年）は17q21-q22への連鎖を見出した（マーカーD17S1820付近の最大ロッドスコアは2.99）。前立腺がんが4例以上あり、診断時の平均年齢が65歳以下である147家族のサブセットでは、同じマーカー付近で最大ロッドスコアが5.49であった。
17q21-q22領域における前立腺がん感受性遺伝子を同定するために、Ewingら（2012年）は、候補領域との連鎖について選択した家族から得た血縁関係のない前立腺がん患者94人の生殖細胞DNA中の202遺伝子から2,009エキソンの塩基配列を決定した。その後、同定された変異の頻度を特徴付けるために、家族、追加の症例対象者、および対照対象者を対象に検査を実施した。4家族のプロバンドが、前立腺の発生に重要なホメオボックス転写因子遺伝子であるHOXB13に、まれではあるが再発性の突然変異であるG84E（rs138213197；604607.0001）を有することが発見された。この4家族の前立腺癌患者18人および入手可能なDNAはすべてこの変異を有していた。解析時点では、G84E変異はdbSNPでも、1,094人の被験者（381人がヨーロッパ系）を含むNCBI 1000 Genomesシークエンスプロジェクトでも報告されていない。前立腺がんに罹患したヨーロッパ系の非血縁被験者5,083人におけるG84E変異の保有率は約20倍に増加し、対照被験者1,401人に1人（0.1％）に対し、72人（1.4％）に変異が認められた（P = 8.5 x 10（-7））。この変異は、早期発症の家族性前立腺がん患者（3.1％）において、後期発症の非家族性前立腺がん患者（0.6％）よりも有意に多く見られた（P = 2.0 x 10（-6））。Ewingら（2012）は、この新規HOXB13 G84Eバリアントは、遺伝性前立腺がんのリスクの有意な上昇と関連すると結論づけた。Ewingら（2012）は、さらに4つのまれなHOXB13変異を同定した。1つはG84E変異が位置する同じMEIS相互作用ドメインに、1つは第2のMEIS結合ドメインに、そして2つはホメオドメインに位置するものである。
Huangら（2014）は、染色体6q22上の前立腺がんリスク関連SNP、rs339331が、HOXB13結合部位として機能する転写因子RFX6遺伝子（612659）のイントロン4内の進化的に保存された領域内にあることを見いだした。rs339331のリスク関連T対立遺伝子は、HOXB13の転写エンハンサーへの結合を増加させ、対立遺伝子特異的にRFX6をアップレギュレートすることを可能にする。RFX6の抑制は、前立腺癌細胞の増殖、移動、浸潤を減少させる。臨床データは、ヒト前立腺癌におけるRFX6のアップレギュレーションが、腫瘍の進行、転移、および生化学的再発のリスクと相関していることを示した。Huangら（2014）は、rs339331におけるリスク関連T対立遺伝子と、ヒト前立腺腫瘍におけるRFX6 mRNAレベルの増加との間に有意な関連を観察した。著者らは、rs339331は、前立腺がん感受性遺伝子HOXB13との機能的相互作用を通じてRFX6の発現を変化させることにより、前立腺がんリスクに影響すると結論づけた。
AR（常染色体劣性） 3
この記事の著者：仲田洋美（医師）
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この記事の筆者：仲田洋美（医師）
