EPCAM遺伝子

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(更新日：2023/01/24)

1 EPCAM遺伝子

EPCAM遺伝子

EPCAM遺伝子産物は細胞間接着に関与するカドヘリン結合活性を持つことが予測される。カドヘリンを介した細胞間接着の負の制御、幹細胞増殖の正の制御、遺伝子発現の制御など、いくつかのプロセスに関与している。基底細胞膜、二細胞性タイトジャンクション、外側細胞膜など、いくつかの細胞構成要素に存在する。タフティング腸症を伴う先天性下痢症5型や遺伝性非ポリポーシス大腸癌8型に関与する。肝細胞癌のバイオマーカー。

遺伝子名:　epithelial cell adhesion molecule
参照：
一次ソース
遺伝子OMIM番号185535
Ensembl:ENSG00000119888
AllianceGenome:HGNC:11529
遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
遺伝子のグループ：CD分子
 MicroRNA protein coding host genes
遺伝子座:　2p21

EPCAM

（参照）

EPCAM遺伝子の発現

大腸（RPKM 501.8）、小腸（RPKM 391.0）、その他9組織で偏った発現を示す

EPCAM遺伝子と関係のある疾患

※OMIIMの中括弧”{ }”は、多因子疾患または感染症に対する感受性に寄与する変異を示す。[ ]は「非疾患」を示し、主に検査値の異常をもたらす遺伝的変異を示す。クエスチョンマーク”? “は、表現型と遺伝子の関係が仮のものであることを示す。
※phenotype mapping key 3は障害の分子的背景が知られていることを意味する。

Diarrhea 5, with tufting enteropathy, congenital　下痢症5-房性腸症、先天性

613217 AR　常染色体劣性、phenotype mapping key　3

先天性タフティング腸症（CTE）は、絨毛の萎縮と炎症の欠如を特徴とし、腸上皮細胞の異形成が十二指腸および空腸に局所的な上皮タフトとして現れるまれな遺伝性の乳児期の難治性下痢症である。CTEは、生後数カ月で慢性の水様性下痢および成長障害を呈し、ほとんどの罹患者は正常な成長および発達のために非経口栄養を必要とする（Sivagnanamらによる要約、2008）。

CTE患者の上皮表面の半定量的評価では、80〜90％にタフトが認められ、セリアック病患者ではわずか16％、正常空腸では10％以下であった（Reifenら、1994）。

Lynch syndrome 8

613244 AD　常染色体優性 phenotype mapping key　3

Chanら（2006）は、3世代の中国人家族において、DNAミスマッチ修復遺伝子変異を認めないMSH2遺伝子（609309）の生殖細胞アレル特異的かつモザイク状の高メチル化が遺伝することを報告した。生殖細胞系列のメチル化を持つ3人の兄弟姉妹は、早発性の大腸癌または子宮内膜癌を発症し、いずれもマイクロサテライト不安定性とMSH2タンパク質の欠損を伴っていた。クローンバイサルファイトシーケンスとパイロシーケンスにより、異なる体組織で異なるメチル化レベルが示され、直腸粘膜と大腸癌組織で最も高く、血液中の白血球で最も低いレベルが記録された。Chanら（2006）は、この組織分布の異なる生殖細胞メチル化のモザイク状態がファーストヒットとなり、従来の白血球を用いた遺伝子診断戦略では見過ごされてきたメンデルパターンから逸脱した遺伝病遺伝のメカニズムを提供する可能性があると仮定している。

Ligtenbergら（2009）は、MSH2プロモーターのメチル化が遺伝的に認められたChanら（2006）の家族を含む、リンチ症候群のオランダ人4家族と中国人2家族において、EPCAM遺伝子の3-プライムエンドに欠失があり、EPCAMを発現する組織ではそのプロモーターがメチル化誘導されて隣接MSH2遺伝子が不活性化されていることを発見している。Ligtenbergら（2009）は、高いマイクロサテライト不安定性とMSH2タンパク質の欠損を示すがMSH2に変異が認められない大腸癌のオランダ人4家族において、EPCAM遺伝子の最も3-プライムの2エキソンを包含するがMSH2遺伝子のプロモーターはそのままの5kbの欠失を検出した（185535.0005）。Chanら(2006)の家族および別の無関係な中国人家族では、EPCAMの3-プライムエンドを包含し、MSH2プロモーターをそのまま残した22.8kbの欠失が見つかった(185535.0006)。この欠失はEPCAMのポリアデニレーションシグナルを含んでおり、転写終結を阻害して、下流のMSH2遺伝子への転写をリードスルーさせる。メチル化は、リンチ症候群の主な標的組織であるEPCAMを発現している組織でのみ起こった。Ligtenbergら（2009）は、この結果から、ポリアデニレーションシグナルの欠失による転写のリードスルーは、近傍遺伝子を不活性化する一般的な変異メカニズムである可能性があると結論づけている。

Kuiperら（2011）は、EPCAM欠失を有するリンチ症候群45家族を解析した。このうち27家族は、原因不明のリンチ様家族のコホートにおいて標的ゲノムスクリーニングによって確認され、18家族は既知のEPCAM欠失を有する既報の家族であった。全体として、19の異なる欠失が見つかり、その全てがEPCAMの最後の2つのエクソンと転写終結シグナルを含んでいた。オランダとドイツでは、EPCAM欠失は、確認されたリンチ症候群の家族の少なくとも2.8％と1.1％を占めるようであった。Kuiperら（2011）は、3-prime EPCAM欠失はリンチ症候群の再発原因であり、ルーチンのリンチ症候群診断検査で探すべきであると結論付けている。