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SMARCB1遺伝子

SMARCB1遺伝子

承認済シンボルSMARCB1
遺伝子:SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1
参照:
HGNC: 11103
NCBI6598
遺伝子OMIM番号601607
Ensembl :ENSG00000099956
UCSC : uc002zyb.4
AllianceGenome : HGNC : 11103
遺伝子のlocus type :タンパク質をコードする
遺伝子のグループ:Protein phosphatase 1 regulatory subunits, PBAF complex, BAF complex
遺伝子座: 22q11.23

SMARCB1遺伝子の機能

SMARCB1遺伝子産物は、BAF(hSWI/SNF)複合体のコアコンポーネントである。このATP依存性クロマチンリモデリング複合体は、細胞の増殖と分化、細胞の抗ウイルス活性腫瘍形成の抑制において重要な役割を果たしている。BAF複合体は、通常よりも少ない負のスーパーコイルを拘束する、安定した変化した形のクロマチンを作ることができる。このスーパーコイルの変化は、ポリヌクレオソームアレイ上のヌクレオソームの最大2分の1が、2個のヒストンオクタマーからなるアルトソームと呼ばれる非対称構造に変換されることによる。in vitroSMARCA4/BRG1/BAF190Aのリモデリング活性を刺激する。CSF1プロモーター活性化に関与。神経前駆細胞特異的クロマチンリモデリング複合体(npBAF複合体)および神経細胞特異的クロマチンリモデリング複合体(nBAF複合体)に属する。神経発生過程において、神経細胞が細胞周期を終えて成体状態に移行する際に、幹細胞/前駆細胞から有糸分裂後のクロマチンリモデリング機構への転換が起こる。増殖中の神経幹/前駆細胞から有糸分裂後の神経細胞への移行には、npBAFおよびnBAF複合体のサブユニット組成の切り替えが必要である。神経前駆細胞が有糸分裂を終えてニューロンに分化すると、ACTL6A/BAF53AおよびPHF10/BAF45Aを含むnpBAF複合体は、相同な代替ACTL6B/BAF53BおよびDPF1/BAF45BまたはDPF3/BAF45Cサブユニットと交換され、ニューロン特異的複合体(nBAF)となる。npBAF複合体は、多能性神経幹細胞の自己複製/増殖能に必須である。nBAF複合体はCRESTと共に樹状突起の成長に必須な遺伝子の活性を制御する役割を果たす(類似性による)。細胞周期制御において重要な役割を果たし、G0/G1における細胞周期の停止を引き起こす。また、ビタミンD受容体(VDR)によってリクルートされるクロマチンリモデリング複合体であるWINAC複合体との結合を介してビタミンD共役転写制御にも関与しており、CYP27B1遺伝子のリガンド結合VDR媒介トランスプレッションに必要である。

SMARCB1遺伝子産物は、Tatタンパク質結合活性、同一タンパク質結合活性、p53結合活性など、いくつかの機能を可能にする。RNAポリメラーゼIコアプロモーター配列特異的DNA結合活性に寄与。ヌクレオソームの分解、DNAテンプレート転写の制御、ヒストン修飾の制御など、いくつかのプロセスに関与。二本鎖DNA中間体を介した一本鎖ウイルスRNA複製の上流またはその内部で働く。線維中心および核形質に位置する。SWI/SNF複合体の一部。コフィン・シリス症候群3、非定型奇形横紋筋腫瘍、神経鞘腫症、神経線維腫症2、横紋筋肉腫に関与。大腸腺がん、肝細胞がん、副鼻腔未分化がん、滑膜肉腫のバイオマーカー
SMARCB1遺伝子によってコードされるタンパク質は、抑制的なクロマチン構造を緩和する複合体の一部であり、転写機構がその標的により効果的にアクセスできるようにする。コードされている核タンパク質は、HIV-1インテグラーゼのDNA結合活性を増強する。この遺伝子は腫瘍抑制因子であることが分かっており、その変異は悪性横紋筋腫瘍と関連している。この遺伝子にはスプライスバリアントが見つかっている。2015年12月、RefSeqより提供。

SMARCB1遺伝子の発現

精巣(RPKM 42.3)、卵巣(RPKM 34.2)、その他25の組織で特異的に発現

SMARCB1遺伝子と関係のある疾患

※OMIIMの中括弧”{ }”は、多因子疾患または感染症に対する感受性に寄与する変異を示す。[ ]は「非疾患」を示し、主に検査値の異常をもたらす遺伝的変異を示す。クエスチョンマーク”? “は、表現型と遺伝子の関係が仮のものであることを示す。エントリ番号の前の数字記号(#)は、記述的なエントリであること、通常は表現型であり、固有の遺伝子座を表さないことを示す。

{Rhabdoid tumor predisposition syndrome 1} ラブドイド腫瘍感受性症候群1

609322

AD  3

ラブドイド瘍素因症候群-1(RTPS1)は、染色体22q11上のSMARCB1遺伝子(601607)のヘテロ接合性の生殖細胞系列変異によって引き起こされるため、この項目には番号記号(#)が用いられている。

SMARCB1遺伝子の体細胞変異は、非定型奇形腫および横紋筋腫(AT/RT)にも認められる。

ラブドイド腫瘍素因症候群は、腎または腎外の悪性ラブドイド腫瘍、および脈絡叢がん、髄芽腫、中枢性原始神経外胚葉腫瘍を含む中枢神経系の様々な腫瘍に罹患しやすい常染色体優性遺伝のがん症候群である(Sevenetら、1999)。

ラブドイド腫瘍は、通常2歳未満の小児に発生する悪性度の高い新生物群である。腎の悪性横紋体腫瘍(MRT)は、ウィルムス腫瘍の肉腫性変異体として最初に報告された(BeckwithとPalmer、1978年)。その後、腎外ラブドイド腫瘍が中枢神経系(CNS)を含む多くの部位で報告された(Parhamら、1994年)。肝臓、軟部組織、およびCNSのラブドイド腫瘍内およびラブドイド腫瘍間で組織学的および免疫学的特徴がかなり異なるため、分類は困難であった。CNSでは、ラブドイド腫瘍は純粋なラブドイド腫瘍または非定型奇形腫瘍(AT/RT)と指定されている変種である。

横紋体腫瘍素因症候群の遺伝的不均一性

染色体19p13上のSMARCA4遺伝子(603254)の生殖細胞系列変異によるRTPS2(613325)も参照のこと。

臨床的特徴

Bonninら(1984年)は、組織学的に異なる中枢神経(CNS)腫瘍を有する腎のラブドイド腫瘍患者7人を記載した。Weeksら(1989年)は、111例のシリーズについて報告し、そのうち腎のラブドイド腫瘍を有する13.5%がCNS悪性腫瘍を有していた。

Burgerら(1998年)は、中枢神経系の非定型奇形/ラブドイド腫瘍患者55人を対象とした小児腫瘍学グループの研究について報告している。この研究の目的は、臨床的および病理学的特徴を明らかにすることであった。病変は主に2歳未満の小児に発生した。新生物は、後頭蓋窩(36人)および脳室上区画(17人)、または両区画に多房性(2人)であった。組織学的に、腫瘍は小細胞と大きく淡い細胞から構成され、ごちゃごちゃした構造配置であった。小細胞成分は髄芽腫に類似しており、時に脊索腫を模した粘液性の背景に細胞の索がみられた。大きな細胞の細胞質は、横紋筋の特徴が常に顕著であるとは限らないが、やや「横紋筋様」な外観で目立っていた。新生物は顕著なポリフェノタイプの免疫反応性を示した。これらの病変がしばしば混同される新生物である髄芽腫の患者とは対照的に、患者の転帰は一様に不良であった。

Sevenetら(1999年)は、悪性ラブドイド腫瘍、非定型奇形腫瘍およびラブドイド腫瘍、脈絡叢がん、および髄芽腫を含む中枢神経系の侵攻性悪性腫瘍の多発症例を兄弟姉妹が有していた血縁関係のない3家系を報告した。すべて3歳未満で発症した。

Taylorら(2000年)は、RTPSの多世代家族を報告した。推定患者は18ヵ月齢で小脳悪性ラブドイド腫瘍を発症した。本人の母親は全く健康であったが、母方の叔父が2歳の時に後頭蓋窩脈絡叢で死亡していた。母方の祖父の兄弟は、小児脳腫瘍と一致する疾患経過により乳児期に死亡していた。

Swensenら(2009)は、SMARCB1遺伝子(601607.0009)の生殖細胞系列重複に関連する4世代にわたる遺伝性神経鞘腫症(162091)の家系を報告した。罹患者は10代で有痛性の皮膚しこりを発症した。変異を有する2人の家族に悪性横紋筋腫瘍がみられ、3人目は横紋筋腫瘍と考えられた。これら3人の患者はすべて2歳前に死亡した。2例のラブドイド腫瘍と数例の神経鞘腫はSMARCB1遺伝子の体細胞欠損を示した。Swensenら(2009年)は、これは両疾患の家族性発症の最初の報告例であると指摘している。

マッピング

Biegelら(1996)は、22q11の500kbスパンの免疫グロブリンラムダ遺伝子座(147220を参照)とBCR(151410)の定常領域遺伝子の間の領域にラブドイド腫瘍遺伝子座をサブローカライズした。

細胞遺伝学

Biegelら(1990年)は、CNSの3つのラブドイド腫瘍におけるモノソミー22を報告し、Biegelら(1992年)は、22q11.2-qterの欠損につながる不均衡な9;22転座を有するラブドイド腫瘍を報告した。Douglassら(1990年)は、モノソミー22を有するCNS腫瘍を報告した。Mullerら(1995年)は、モノソミー22を有する松果体領域のラブドイド腫瘍を報告した。

Burgerら(1998)は、22番染色体に対するプローブを用いて、CNSの非定型奇形腫/ラブドイド腫瘍の8症例中7症例がFISHにより孤立性のシグナルを示し、モノソミー22と一致することを見出した。8例目はFISHで3つのシグナルを示し、従来の細胞遺伝学で報告された22番染色体の転座を有していた。

Misawaら(2004)は、新たに樹立した腎外横紋筋腫由来の細胞株において、t(1;22)の転座と22q11.2の同時欠失を伴い、SNF5(SMARCB1)遺伝子のホモ接合性欠失を観察した。患者は生後5ヵ月の男児で、診断時には転移のない胸部腫瘤が認められた。末梢リンパ球の細胞遺伝学的解析により、正常な男性の核型が示された。全摘出、化学療法、放射線療法の併用により、4歳までに完全寛解した。

分子遺伝学

SMARCB1遺伝子の生殖細胞系列変異

横紋筋素因症候群の3つの異なる家系の罹患者において、Sevenetら(1999年)はSMARCB1遺伝子(例えば、601607.0003を参照)におけるヘテロ接合性の生殖細胞系列機能喪失型突然変異を同定した。腫瘍組織が入手可能な場合は、SMARCB1遺伝子座における体細胞性ヘテロ接合体欠損(LOH)を示した。検査されたすべての症例において、両親のDNAは正常なSNF5/INI1配列を示し、それにより変異のde novo発生が示された。これらのデータから、この遺伝子の体質的変異は腎または腎外MRTになりやすく、また脈絡叢癌、髄芽腫、中枢性原始神経外胚葉腫瘍などの中枢神経系の様々な腫瘍にもなりやすいことが示された。

Taylorら(2000)は、RTPSの多世代家族において、SMARCB1遺伝子のヘテロ接合性のスプライス部位変異(601607.0004)を同定した。この患者の母親もこの変異を有していた。

SMARCB1遺伝子の体細胞突然変異

Versteegeら(1998)は、悪性横紋筋腫の13の細胞株から、染色体22q11.2の最も頻繁に欠失する部分をマッピングし、SNF5/INI1遺伝子の領域に当たる重複の最も小さい領域を画定する6つのホモ接合性欠失を観察した。これらの系統のうち12系統を解析したところ、SMARCB1遺伝子にフレームシフト変異またはナンセンス変異が認められた(例えば、601607.0001; 601607.0002を参照)。全て、もう一方の対立遺伝子におけるヘテロ接合性の消失(LOH)と関連しており、発癌の2ヒット劣性モデルと一致し、SNF5/INI1がMRT癌抑制遺伝子であるという仮説と一致していた。Versteegeら(1998)は、酵母からヒトまでの生物で同定されているSWI/SNF複合体がクロマチン構造のリモデリングに重要であると考えられていることを指摘し、特定のDNA部位におけるクロマチン構造の変化が発癌の過程において重要である可能性があると結論づけた。

{Schwannomatosis-1, susceptibility to} 多発性神経鞘腫1感受性

162091

AD  3

神経鞘腫症-1(SWN1)の発症感受性は、染色体22q11上の癌抑制遺伝子SMARCB1(601607)の生殖細胞系列のヘテロ接合体変異によってもたらされるため、この項目には番号記号(#)が用いられている。

シュワンノマトーシス-1(SWN1)は、前庭神経への浸潤を伴わない、頭蓋内、脊髄、末梢の多発性神経鞘腫の発症を特徴とする。罹患者はまた、多発性髄膜腫を有することがある(Bacciら、2010年による要約)。

神経鞘腫症はneurilemmomatosisとしても知られ、神経線維腫症3型として新村(1973)により最初に報告された。

神経鞘腫症の遺伝的不均一性

染色体22q11上のLZTR1遺伝子(600574)の生殖細胞系列のヘテロ接合体変異により生じる神経鞘腫症-2(615670)も参照のこと。

神経鞘腫症患者の個々の神経鞘腫腫瘍は、SMARCB1の体細胞変異を有することが判明している。

臨床的特徴

Swensenら(2009)は、SMARCB1遺伝子の生殖細胞系列重複(601607.0009)に関連した4世代にわたる遺伝性神経鞘腫症の家系を報告した。罹患者は10代で有痛性の皮膚しこりを発症した。変異を有する2人の家族に悪性ラブドイド腫瘍がみられ(609322)、3人目はラブドイド腫瘍と考えられた。これら3人の患者はすべて2歳前に死亡した。2例のラブドイド腫瘍と数例の神経鞘腫でSMARCB1遺伝子の体細胞欠損が認められた。

Bacciら(2010年)は、4人が多発性神経鞘腫および髄膜腫を有していた家族を報告した。プローバントは33歳の男性で、30歳頃に初めて脚に多発性の末梢神経鞘腫を認めた。脳画像検査では、左舌下孔周囲に小型の髄膜腫または神経鞘腫と一致する軸外腫瘤病変が認められ、脊髄画像検査では脊髄全体に複数の軸外腫瘤病変および硬膜内腫瘤病変が認められた。また、体幹と脚に多発性のカフェオレ斑と有痛性のしこりがあった。55歳の時、父親が多発性脊髄神経鞘腫と2つの髄膜腫を有していることが判明した。この患者の父方の叔母には数個の線維性髄膜腫があり、従兄弟には多発性脊髄神経鞘腫があった。遺伝子解析により、すべての患者でSMARCB1遺伝子のヘテロ接合性の生殖細胞系列変異(E31V;601607.0010)が同定された。この患者の腫瘍組織を調査したところ、SMARCB1遺伝子とNF2遺伝子の両方を含む22番染色体上のマーカーについてヘテロ接合性の消失(LOH)が認められた。Bacciら(2010年)は、髄膜腫は神経鞘腫症患者では頻繁に認められるものではないが、表現型の一部と考えるべきであると指摘している。

Christiaansら(2011年)は、5人が髄膜腫(607174)を発症し、うち2人は神経鞘腫も発症した家族を報告した。すべての患者がSMARCB1遺伝子にヘテロ接合性の変異(P48L;601607.0011)を有し、髄膜腫腫瘍では野生型対立遺伝子の欠損が認められ、腫瘍形成の2ヒット仮説と一致した。髄膜腫は34~56歳の間に発生し、頭蓋では軸外病変として、脊髄では髄外病変として発生した。さらに、1人の患者は胸壁および脊髄神経鞘腫を多発し、もう1人は前庭神経鞘腫を単発した。同じ患者から発生した2つの異なる髄膜腫腫瘍は、NF2遺伝子座におけるヘテロ接合性の欠損と同様に、NF2遺伝子(607379)における2つの異なるヘテロ接合性の体細胞変異を有していた。Christiaansら(2011年)は、SMARCB1 P48L変異は保因者に髄膜腫の発生素因があると結論づけた。Bacciら(2010)が示唆したように、髄膜腫は神経鞘腫症の腫瘍スペクトルの一部である可能性を示唆しているが、神経鞘腫は偶然の所見である可能性もある。NF2変異の役割は不明であるが、2つの遺伝子が関与する4ヒット仮説に寄与する可能性がある。Van den Munckhofら(2012年)は、Christiaansら(2011年)が報告した家族のさらなる研究を行った。髄膜腫4例と神経鞘腫2例の腫瘍組織を再調査したところ、すべての腫瘍でSMARCB1とNF2の両方がLOHであり、これら2遺伝子を含む22番染色体セグメントの欠失と一致した。髄膜腫3例と神経鞘腫2例はそれぞれNF2遺伝子の体細胞変異を有していた。すなわち、エクソン2変異の保持、NF2変異の獲得、および両遺伝子の野生型対立遺伝子のLOHである。さらにvan den Munckhofら(2012年)は、この家族においてさらに11人のP48L変異保因者を同定した。これら11人の変異保有者のうち8人は頭蓋髄膜腫を示唆する病変を11個、髄膜腫または神経鞘腫に一致する脊髄病変を6個有していた。11個の頭蓋髄膜腫のうち9個(82%)が大脳鎌に認められた。Van den Munckhofら(2012年)は、髄膜腫は神経鞘腫症の腫瘍スペクトラムに含まれるべきであると結論づけた。

神経線維腫症II型との鑑別

神経鞘腫は末梢神経鞘の良性腫瘍で、通常、健常人に単独で発生する。同一個体に神経鞘腫が多発する場合は、腫瘍素因症候群の存在が示唆される。このような症候群として最も一般的なのは神経線維腫症IIである。NF2の特徴は両側前庭神経鞘腫の発生であるが、NF2罹患者全体の3分の2以上が他の部位に神経鞘腫を発生し、NF2罹患小児では前庭腫瘍に先行して皮膚神経鞘腫(または神経鞘腫)が発生することがある(Evansら、1992;Mautnerら、1993;Parryら、1994)。MacCollinら(1996年)は、前庭神経鞘腫の証拠を示さない多発性神経鞘腫の患者の報告を検討し、神経鞘腫症は他の神経線維腫症とは異なる臨床的実体であることを示唆した。

佐々木と中島(1992年)は、8歳の日本人女児と5歳の日本人男児における多発性皮膚神経鞘腫について報告した。男児の父親にはNF2を示唆する両側の音響神経腫があり、また病理組織学的に神経鞘腫と診断された複数の皮膚腫瘍があった。色素斑はなかった。多発性皮膚腫瘍は2人の子供に出生時から存在していた。しかし、Jacobyら(1997)は、前庭神経鞘腫は思春期まで明らかでないことがあるため、これらの小児ではNF2を除外できないとコメントしている。加えて、Jacobyら(1997年)は、NF2の家族歴が陽性で、彼らの臨床基準(DIAGNOSISを参照)を満たす神経鞘腫症の報告は過去になかったと述べている。

Evansら(1997)は、常染色体優性遺伝する神経鞘腫症の5家族を報告した。その表現型は一貫しており、多発性の皮膚および脊髄腫瘍がみられ、頭蓋は比較的温存されていた。6番目の家系は、当初神経鞘腫症と思われたが、両側性音響神経腫を発症し、後にNF2に分類された。神経鞘腫症を有する2つの大家族における遺伝的連鎖は、NF2遺伝子の領域における染色体22q12.2との連鎖を示した。Evansら(1997)は、2つの疾患の鑑別が困難であることを指摘し、神経鞘腫症と考えられる若年患者はNF2の変異型である可能性を示唆した。

診断

Jacobyら(1997年)が用いた神経鞘腫症の診断基準は以下の通りである。
病理学的に証明された神経鞘腫が2個以上あり、18歳以上で前庭神経腫瘍のX線所見がない場合は、神経鞘腫症が確定診断される。推定または可能性のある神経鞘腫症については、病理学的に証明された神経鞘腫が2個以上あり、30歳以上で第8神経機能障害の症状がない場合、または解剖学的に限定された分布(単一の四肢または脊椎のセグメント)で病理学的に証明された神経鞘腫が2個以上あり、年齢に関係なく第8神経機能障害の症状がない場合を基準とした。

Coffin-Siris syndrome 3 コフィン・シリス症候群3

614608

AD  3

Coffin-Siris症候群-3(CSS3)は、染色体22q11上のSMARCB1遺伝子(601607)のヘテロ接合体変異によって引き起こされるという証拠があるため、本エントリでは番号記号(#)を使用している。 SMARCB1遺伝子は、クロマチンリモデリング因子として機能するSWI/SNF複合体(BAF複合体としても知られる)のサブユニットをコードするいくつかの遺伝子のうちの1つである。

Coffin-Siris症候群は、発達遅延、知的障害、粗い顔貌、摂食障害、第5指爪および第5遠位指骨の低形成または欠如を特徴とする先天性奇形症候群である。また、より多様な特徴を示すこともある。SMARCB1遺伝子変異を有する患者は、重度の知的障害、脳の構造異常、表出性言語の欠如、側弯症など、より重篤な神経発達障害を有する可能性がある(Koshoらによる要約、2014年)。

Coffin-Siris症候群の一般的な表現型の説明と遺伝的不均一性の議論については、CSS1 (135900)を参照のこと。

臨床的特徴

Tsurusakiら(2012)は、4例のコフィン・シリス症候群患者においてSMARCB1変異を同定した。4例中2例に痙攣発作があり、2例ともダンディ・ウォーカー奇形を認めなかった。4人中3人に難聴があった。4人全員に第5指または足の爪がないか低形成で、頭皮の毛はまばらで、眉毛は太く、まつ毛は長かった。3人中3人に歯列異常の遅発性、3人中2人に涙道非機能または欠如、4人中3人に多毛がみられた。4人全員が、鼻が広く、口が広く、唇が厚く、耳が異常で、口蓋が高く、粗い顔貌であった。4人全員が低身長で、4人中3人に脊椎異常があり、全員に摂食障害があった。手と足の第5指骨の形成不全と骨年齢の遅れが1人の患者にみられた。その他の表現型はより多様であった。写真が提示された2人の患者は、異形ではあったが、互いに似ていなかった。

CSS患者の大規模コホートの研究において、Wieczorekら(2013年)Santenら(2013年)は、CSS3患者は他の形態のCSS患者と比較して最も重篤な表現型を有することを明らかにした。典型的な顔貌、多毛、他の爪の低形成に伴う第5指および足指の爪の低形成または欠如に加え、これらの患者には全体的な成長不良、低身長、小頭症、重度の発達遅延、摂食障害がみられた。また、多くの患者に痙攣、先天性心疾患、聴覚障害、小脳、脳梁の異常がみられた。

分子遺伝学

鶴崎ら(2012)は、コフィン・シリス症候群の4人の患者において、1人にSMARCB1遺伝子のヘテロ接合ミスセンス変異(601607.0013)を、3人に同じシングルコドン欠失(601607.0012)を同定した。SMARCB1の生殖細胞系列のヘテロ接合体切断変異は、横紋体腫瘍素因症候群-1 (609322)の個体で報告されており、SMARCB1のさまざまなタイプの変異が、家族性および散発性神経鞘腫症 (162091)の個体の生殖細胞系列で報告されている。CSS3の原因となったSMARCB1の変異は非切断型であり、機能獲得型または優性陰性効果を示すことを示唆している(原因としてハプロ不全を除く)。

Kleefstraら(2012)は、症候群性精神遅滞の患者において、SMARCB1遺伝子のミスセンス変異(R37H;601607.0014)を検出した。この患者は、Kleefstra症候群(610253)の中核的特徴を共有するが、それ以外は表現型的に異質な、症候群性精神遅滞患者9人のうちの1人であった。

Wieczorekら(2013)は、全エクソームシークエンシング、23のSWI/SNF複合体遺伝子の次世代シークエンシング、および分子核型分類を併用し、コフィン・シリス症候群または同様の特徴を示すニコライデス-バライツァー症候群(NCBRS;601358)に一致する臨床表現型を有する患者46例中28例(60%)に変異を同定した。SMARCB1遺伝子に変異を有する患者は2例のみであり、そのうちの1例はNCBRSと診断された。このことは、これらの症候群が2つの異なる疾患ではなく、表現型のスペクトラムを示す可能性を示唆している。変異体の機能研究や患者細胞の研究は行われなかった。

Santenら(2013年)は、血縁関係のないCSS3患者4人において、SMARCB1遺伝子のヘテロ接合性の病原性変異を同定した。この変異は、親のDNAが入手できた3人の患者においてde novoで生じたことが示された。3人の患者は同じ変異(K364del; 601607.0012)を有していた。これらの患者は、BAF複合体の6遺伝子の変異についてスクリーニングを受けたCSSと臨床診断された患者63人からなる大規模コホートから確認された。変異体の機能研究および患者細胞の研究は行われなかった。

Rhabdoid tumors, somatic ラブドイド腫瘍、体細胞性

609322

 

3

Versteegeら(1998)は、悪性横紋筋腫由来の13の細胞株パネルから、22q11.2染色体の最も頻繁に欠失する部分をマッピングし、SNF5/INI1遺伝子の領域に当たる、重複する最小領域を画定する6つのホモ接合性欠失を観察した。これらの系統のうち12系統を解析したところ、SMARCB1遺伝子にフレームシフト変異またはナンセンス変異が認められた(例えば、601607.0001; 601607.0002を参照)。全て、もう一方の対立遺伝子におけるヘテロ接合性の消失(LOH)と関連しており、発癌の2ヒット劣性モデルと一致し、SNF5/INI1がMRT癌抑制遺伝子であるという仮説と一致していた。Versteegeら(1998)は、酵母からヒトまでの生物で同定されているSWI/SNF複合体がクロマチン構造のリモデリングに重要であると考えられていることを指摘し、特定のDNA部位におけるクロマチン構造の変化が発癌の過程において重要である可能性があると結論づけた。

この記事の著者:仲田洋美(医師)

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この記事の筆者:仲田洋美(医師)

ミネルバクリニック院長・仲田洋美は、日本内科学会内科専門医、日本臨床腫瘍学会がん薬物療法専門医 、日本人類遺伝学会臨床遺伝専門医として従事し、患者様の心に寄り添った診療を心がけています。

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